EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11205 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:1098108-1099708 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXD9MA0913.2chr4:1098136-1098146GCAATAAAAC+6.02
NEUROD1MA1109.1chr4:1098972-1098985GAACAGATGGCGG+6.57
NEUROD1MA1109.1chr4:1099084-1099097GAACAGATGGCGG+6.57
Rarg(var.2)MA0860.1chr4:1099521-1099538AAGGTTACAAAAGGTCA+6.72
SOX8MA0868.2chr4:1098543-1098553AGAACAATGG+6.02
SOX8MA0868.2chr4:1098627-1098637AGAACAATGG+6.02
Enhancer Sequence
TATACCCCCC CAAAAAATAA TGTAAAATGC AATAAAACTG CAACTGCAGA AACAAATGAA 60
TATGAGATGG AAACATAAAA AATTAAAACT GACATGCGAT ATAGAGATAA AGCTAAACAG 120
ACATGGTTTA AACCCTAAAG AAGAAATACA AAAGCACATA CAATTACACA ACACTGGAGG 180
AGCTACAGGA CACTGAATAG AAGGTGGAGC TACAGAACAG TGGAACAGAA GGGGGAGCGA 240
CAACACTGGA ACAGATGGTG GAGCTACAGA ACAGTGGAAT AGAAGGCGGA GCTACAGAAC 300
AGTGGAACAG ATGGTGGAGC TACAGAACAG TGGAATAGAA GGCGGAGCTA CAGAACAGTG 360
GAACAGATGG TGGAGCTACA GAACAGTGGA ATAGAAGGCG GAGCGACAGA ACAGTGGAAT 420
AGAAGGCGGA GCTACAGAAC AATGGAACAG ATGGTGGAGC TACAGAACAG TGGAATAGAA 480
GGCGGAGCGA CAGAACAGTG GAATAGAAGG CGGAGCTACA GAACAATGGA ACAGATGGTG 540
GAGCTACAGA ACAGTGGAAT AGAAGGCGGA GCTACAGAAC ATTGGAACAG ATGGTGGAGC 600
AACAGAACAG TGGAATAGAA GGCGGAGCTA CAGAACATTG GAACAGATGG TGGAGCAACA 660
AAACAGTGGA ATAGAAGGCG GAGCTACAAA ACATTGGAAC AGATGGTGGA GCAACAGAAC 720
AGTGGAATAG AAGGCGGAGC TACAGAACAC TGGAAAAGAG GGTGGAGCTA CAGAACAGTG 780
GAATAGAAGG CGGAGCTACA AAACACTGGA AAAGATGGTG GAGCTACAGA ACAGTGGAAT 840
AGAAGGCGGA GCTACAAAAC ACTGGAACAG ATGGCGGAGC TACAGAACAG TGGAATAGAA 900
GGCGGAGCTA CAAAACACTG GAACAGATGG TGGAGCTAAA GAACAGTGAA ATAGAAGGCG 960
GAGCTACAAA ACACTGGAAC AGATGGCGGA GCTACAGAAC AGTGGAATAG AAGGCGGAGC 1020
TACAGAACAT TGGAAAAGAT GGTGGAGCTA CAGAACATTA GAATAAAATG CGGAGCTACA 1080
GGACACAGTA AAATAAGGCT GAGCTATAGA GCAATAAAAT AGAAGACGGA GCTACAGACC 1140
ACTAGAGGTG GAGCTACAGG ACACAGGAGG AGCTTCAAAA TATTGAGCTA CAGAACACAA 1200
AAGAGGCTTA GAAGGCGGAG CTACAAAACA CAAAAGAGGC TTAGAAGGCG GAGCTACAGA 1260
ACACAAAAGG AGCTTAGAAG GCGGAGCTAC AGAACACAAT AGAGGCTTAG AAGGCGGAGC 1320
TACAGAACAC AGAAGGAGCT TAGAAGGTGG AGCTACAAAA GGTAGCCTAA CTATTAAGTA 1380
ACTGCCTAAC TATAAAAAAT AAATAGTTCT CCGAAGGTTA CAAAAGGTCA TGAGAAGCAT 1440
TTCCTCTAGA CAAATGTGTC CACAAAACAG TGGACAAGGA TGCACTAACT GTACCATTGT 1500
TAAATGTGCT GTTCCCTCAG CTCTCACACA CTGCAGCCCA GTGAATCCCA CTGCATGTGC 1560
CACTGCACTG TACAGCGCGC GCGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1600