EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11200 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:970815-972127 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr4:970923-970934ATATTAATTAT+6.02
CTCFMA0139.1chr4:972096-972115GAGCGCCCCCTGTTGGCCT-6.61
CTCFLMA1102.1chr4:972097-972111AGCGCCCCCTGTTG-6.24
NR2F2MA1111.1chr4:971050-971061TTTGACCTTTA-6.32
Enhancer Sequence
TTTGCACTAT ATAGTAACTG TTCAAAAGTA GCTCATAATT TATTAATTTA TTCCAGCGAT 60
TTTTAAGATG AAGTTTTAGC TTCATCATTC CATTCAGAAA TCACTCTGAT ATTAATTATT 120
ATTATTATTA TTATTAATAG TAATAAAAGC AGTAATGACT GGAGTAATAA TATCATTTCA 180
AACTACATAC AATAAGAAAA CAGTTATTTA ACATGAAAAA AACTGACCCC AAACTTTTGA 240
CCTTTAATAT ATATATAGAG AGATAGAGAG AGAGAGAGAG AGAAACAGAC GGACGGACAG 300
ACAGACGAAC AAGTAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG 360
ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG 420
ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGACAGAC GGATAGATAG ACAGACAGAC AGACAGACAG 480
ATGGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAT AGATAGATAG ACAGATAGAT AGACAGACGG 540
ACAGACGGAT AGATAGACAG ATGGATAGAT GGACAGACAG AAAGACAGAC AGACAGACAG 600
ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG 660
ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG AATTTAAAGT CATTACATTC 720
GGTGCTTCAC AATAAGAGGG GCGGGTGGAT TGGAGTCTCT CCATACTGAA GGCAGCCACA 780
GGACCACGGT GCCAGTGCGC TTACTTTACT TTACTTACTT TACTGTCCCA AAGTGTAAAC 840
TTATCGTTGG CTTCACCACA CACAACCACA TCAGCGTTCA CATTACACAC ATCACAGAAA 900
AAAACAGGCA ACACAAATAC AATGTCATCA CATATATCAC ATTAAAAACT CAATATAAAA 960
CCCTGCACAT ACTTACAACC CAGTATTCAC AATTCTAATG GCAGTCGACA CAAAGGAAAA 1020
ACATTTGATA ACCACTCATT AGCTGTTGGT GGAGTGGAGA GACAGACTCA GTGGATGGCG 1080
ATGTTATAGA GTCCATGATC AGTAAGGCCT GATGGAAGGA ATTTGGCCAG GACACCGGGG 1140
TCACACCCCT ACTCTTTACG AGAAGTGCCA TGGGATTTTT AATGACCACA GAGAGTCAGG 1200
ACCTCGGTTT AACGTCTCAT CCGAAAGACG ACACTACCCT TCACTATTCT GGGGCATCAA 1260
TACTCACTCA GACTGCAGGT TGAGCGCCCC CTGTTGGCCT CACTGACACC AC 1312