EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11197 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr4:906397-907270 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr4:907196-907206TCTAATTAAA+6.02
ARGFXMA1463.1chr4:907196-907206TCTAATTAAA+6.02
ELK1MA0028.2chr4:907048-907058CACTTCCGGT-6.02
ERFMA0760.1chr4:907048-907058CACTTCCGGT-6.02
ERGMA0474.2chr4:907048-907058CACTTCCGGT-6.02
ETS1MA0098.3chr4:907048-907058CACTTCCGGT-6.02
ETV3MA0763.1chr4:907048-907058CACTTCCGGT-6.02
ETV5MA0765.1chr4:907048-907058CACTTCCGGT-6.02
FEVMA0156.2chr4:907048-907058CACTTCCGGT-6.02
FLI1MA0475.2chr4:907048-907058CACTTCCGGT-6.02
FOXF2MA0030.1chr4:907017-907031TTTGTTTACCTTAA-6.38
Foxj3MA0851.1chr4:907014-907031TCTTTTGTTTACCTTAA-6.77
LMX1BMA0703.2chr4:907097-907108ATTTTAATTAA+6.62
POU3F1MA0786.1chr4:906730-906742TTATGCTAATGA+6.22
POU3F2MA0787.1chr4:906730-906742TTATGCTAATGA+6.44
Enhancer Sequence
AACATGGGAG AACATCTCTA GGTATTCATT TCTATAGTGG GCAGCAGGGG ACGCCGCTTC 60
ACCACTGAAT TTGGTCTGTG GATAAATAAT TCAGTCAGAT TACTTCTCTT TAAACACACT 120
TGTGATGAAC ATAAACTGTT CATATGTTGT TATATTCTGC TGATCTCCGC TGATTCTCCT 180
TTTAAATAAC TCATATTTCC ACATTTGAAA ACAACGCGAA TGTGTTGCAG ATTTGTTTAT 240
CTAGTGGTGT TTTATTTAGA GTCTCTAGCA TTGATTTATT CATAAACACA GAGGATTTCG 300
ATAATGAGCA ATAATTCCTC TGCCTGATAA TGCTTATGCT AATGAATGGA TGTGCTGTTA 360
AGCTAATAGT TGAATTTCTG ATTGTTTTAT AACCGTTTGT CGTGGGATTC AGTATAATCT 420
GGATGTAAAT ACGCGTCTGT ATGCTTCTTC TGTTTTTAGA AACTGTTTCA GCTGTTCAGC 480
TAATATAAAA CTATGTAGGC CACTTTGTTT CTGATTTTGT ATCATTATTA TTAGGCTGTT 540
GTTGTTGTTA TTAACGTTAC TATTATTATT AGCTTTCCCT CGAGGACTCT GAAACATTTT 600
TAAAATATTT AAACAAATCT TTTGTTTACC TTAACCGCGC GCTGCCACAG ACACTTCCGG 660
TTCCTGTCAC TTCACCTTTA CAACCGTAGT TTGTTAATTT ATTTTAATTA ACACAACCAT 720
GAAGGCGCTG GCTTGTCACA CAAATCTCAC CTACAGCACT TTGTCATTTG TTATCTACAA 780
AGAGATGAAC CCCAACATGT CTAATTAAAA TGTACTACTT AAAATATTTC AGAATAGACT 840
ATCTTCATGA ACCCCCAAAA CATGCTAATT ATC 873