EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11168 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:62332885-62334299 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr3:62333791-62333807TGCTAAGTAAACACAC+6.31
FOXD2MA0847.2chr3:62333792-62333805GCTAAGTAAACAC+6.1
Foxa2MA0047.2chr3:62333792-62333804GCTAAGTAAACA-6.52
KLF9MA1107.1chr3:62333903-62333916CCCCACACCCACA+6.02
Enhancer Sequence
CCTTTTTTTC TCTGATTCTG ACAATCAATA ACGGCAACCC AGACCACACA CAACCTAAAA 60
ATACAAAAAG CACCTCTACT TTGAGGGGTT TATATTAACA CAGACAACAC ATGCACTTAT 120
TTTATTCACC TTCAGCAGTG TGTTAAGACA ATTCAAAGGG TTTCTTTAAG AGACCATCGT 180
TTGCGTGTAC ACCTCTGCAT GTGGATCTGG GAAGCTTTTG AGTTTGGGTA GGCACAATCC 240
AGGCGGAAAC CCCAAAATAG CACTTGACTT TCAGAGGTTT AACTAACGCT GGTGACCTGA 300
GCGCAGACAG ATGCTCAACA CAGTTCTGGA GGGAATAACA ACAGAAGAAG AAGAAGAAGA 360
ACACTGAAGC ACTGTGATGA CGGACTGACG GAGGACTTTT ACAATCAGCA CAGCAACATC 420
TCACATCTGA CACACTGGAG ATCTGCAGAC CAACATTACT GACGCAAACA CCCTCACCAC 480
ATCCTGCTGA TCACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 540
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACCT GGCTGTGGCA TTAGAGCTGG 600
AGCAGATCTC TGTAGGACTG GTGCTCTCTG GGATGGGTGT TGCCCATCCC TGACCTGCAT 660
GATGATGTGC AGAAGCTGTA GTGTGAGTTT TCAGAGACTC AGAGATTCAG CGCTGTTTCA 720
AAAAGCCTTT CAGACTGGAC CTTTAAGAAG AGGAATGAAG CTGAGGACAG GCCAGGCCGT 780
ATGTTTAAGA CTGTACTCTT ATTAAAGGAC CTCGACACAC ACTCGGGGAT TAGTTTAGAC 840
AGATTAATCT GCTGCTGTAG TCAGAGTTAG CCTAGTTTTG GGGAGATGGG TTTGTCCATA 900
AAATATTGCT AAGTAAACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 960
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAT ACACTCACAC ACACAACCCC 1020
CCACACCCAC ACAATCTCAC TCACTCACTC ACACACACTC ACACACACAC ACTCACACAC 1080
ACACACACAC ACACACATGC TCTGAGTGTT AATTGCCAGT AAAGCAGGCG GTGGGCCGGG 1140
GGGGTCTGGC TCTTTGTGGT GTAGTGGTTG AAGGGTTTTC GGGGGTCTTG ATTAATTTGT 1200
AGTGTCATAT GTGGGAGGGT TCATTGGGAT GGGGGTTATG GGAATGTACC AAACTCTAAA 1260
CAGTGTGAGA AACACGGAGG AAATGCTAAT GGAGAAATGA ATATTCAACA CTACCTCATA 1320
ACCCGCTCTT ATTTCCTCCA CACAAGGAAC CGGCCGCACA CTCCAACAAC ACTCACAGAG 1380
TCAAAGCCAA GTCAGCCTTC AGCTGAGAAT GTGT 1414