EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11165 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:62211953-62213186 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RREB1MA0073.1chr3:62212731-62212751TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT-6.16
RREB1MA0073.1chr3:62212755-62212775TGTGTGTGTGTGGTGTGTGT-6.16
STAT1MA0137.3chr3:62213029-62213040TTTCCCAGAAA-6.02
STAT3MA0144.2chr3:62213029-62213040TTTCCCAGAAA-6.32
Stat4MA0518.1chr3:62213026-62213040CCATTTCCCAGAAA-6.98
TFAP4MA0691.1chr3:62212016-62212026AACAGCTGAT+6.02
TFAP4MA0691.1chr3:62212016-62212026AACAGCTGAT+6.02
TFAP4MA0691.1chr3:62212016-62212026AACAGCTGAT-6.02
Enhancer Sequence
ACCCCTGATG AATAAATGGA ATAATCTGAA GGAGATGAAT GACTACAAAG CTGACAGAAT 60
GAAAACAGCT GATGGAGTAT ACACTAACCT GCACATTATT CAGACACTAG ATGGAGACAA 120
ACAGACAAAA ACAGCAGCAT TACAGACGAG CAGAGATAGA TAGATAGATA GACGGATAGA 180
TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGACGGA 240
TAGACAGATA GACAGATAGA CAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGACG GATAGACGGA 300
TAGATAGATA GATAGATAGA CAGACAGACA GACAGACAGA CAGATAGATA GATAGATAGA 360
TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GACAGATAGA CAGATAGACA GATAGATAGA 420
TAGATAGACA GACAGACAGA CAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA 480
TATACAGATA GATAGATGAT AGATAGATAT ACAGATAGAC AGATAGACAG ATAGATAGAT 540
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGACAGATAG ATAGATAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC 600
AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATATACAG ATAGATATAC 660
AGATAGATAG ATAGAGGTGA ATGCATCACT GATGTTATTC AGCGGTTGTT ATCTGGCAGA 720
AACACACACT GGAATGTCAC AACTGACCCG TCAGTATGCA GTACTGCAGA CAGTGTAATG 780
TGTGTGTGTG GTGTGTGTGT AGTGTGTGTG TGTGGTGTGT GTGTAGTGTG TGTGCGGTGT 840
GTGTGTAGTG TGTGTGTAGT TTATTGTGCA GAAGTATTCT CGGGTTATCT GTAGTCTTTG 900
TGTTGAATCT GCCGGCTGAA TGTGCTGTGA TACACCGCCA GTAAACTCGT CTGACTGTCG 960
TAAACTCGCA CGGTTGGCCT GAAGATTAAA GCCGAGCCGC TGCATGATCA TAAACCCTCC 1020
ACTCAGATCA CACACGGCTA CATCACAGAC TGTAAATCAG CGGCGAATAC ACTCCATTTC 1080
CCAGAAAAAC CCTTAGCTTG ACTTCTCCTG CAGTCATCGA GACCTGTTAT AGAGGAGTGT 1140
GTAGAATCAG TTCCTCAATA TAACCCTTAC AGACTCTACT CCAGACACTA CACTAGAGGA 1200
GAGGAGAGTG TTCAGACATC ATGAGGAGAC ATG 1233