EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11150 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:60426551-60428793 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr3:60426824-60426835TGATTAGATTA-6.32
DUXAMA0884.1chr3:60426823-60426836CTGATTAGATTAA-6.82
POU6F2MA0793.1chr3:60426707-60426717ATAATGAGCT-6.02
RREB1MA0073.1chr3:60426766-60426786ACCCAACACACACACACACA+6.71
SPICMA0687.1chr3:60427059-60427073AGAAAAAGGAAGTA+6.2
ZNF263MA0528.1chr3:60426968-60426989AGAGGAGGAAAGAGGAAGAGG+6.24
ZNF263MA0528.1chr3:60426972-60426993GAGGAAAGAGGAAGAGGAGGA+6.26
ZNF263MA0528.1chr3:60427168-60427189CGAGGAGGAGGACGAGGAGAG+6.36
ZNF263MA0528.1chr3:60427174-60427195GGAGGACGAGGAGAGGAGAAG+6.43
ZNF263MA0528.1chr3:60426981-60427002GGAAGAGGAGGAGAAGAAAAG+6.45
ZNF263MA0528.1chr3:60426951-60426972GGAGGAGAGAAGGAAGAAGAG+6.51
ZNF263MA0528.1chr3:60426939-60426960AGAAGAGGAGGAGGAGGAGAG+7.03
ZNF263MA0528.1chr3:60426978-60426999AGAGGAAGAGGAGGAGAAGAA+7.19
ZNF263MA0528.1chr3:60426975-60426996GAAAGAGGAAGAGGAGGAGAA+7.33
ZNF263MA0528.1chr3:60426948-60426969GGAGGAGGAGAGAAGGAAGAA+7.39
ZNF263MA0528.1chr3:60426956-60426977AGAGAAGGAAGAAGAGGAGGA+7.52
ZNF263MA0528.1chr3:60426942-60426963AGAGGAGGAGGAGGAGAGAAG+7.74
ZNF263MA0528.1chr3:60426945-60426966GGAGGAGGAGGAGAGAAGGAA+7.74
ZNF263MA0528.1chr3:60426959-60426980GAAGGAAGAAGAGGAGGAAAG+7.76
ZNF263MA0528.1chr3:60427171-60427192GGAGGAGGACGAGGAGAGGAG+8.1
Enhancer Sequence
AGACTAAACA AAACAATTCC TGAACATCTG TGCACACAGA AATGATTCAT TGGTAACTAA 60
ATGGTTTGGC AAAATCAGCA CCCAGCCCCA TTCATAAAGA GAGCGCAGGG CAGGGCGATG 120
TGCTCCGGTA CGACTGTGTT TTATGATGCT GCTGTAATAA TGAGCTGTTT TCTGCCTGGG 180
TGGATTTACA GTGCTGGAGC TGCGGCCCCT CGGAGACCCA ACACACACAC ACACACACAC 240
ACACACACAC ACACACACAC ACACACTGCT GCCTGATTAG ATTAAACTCT GCTCCTGCAA 300
TCGCAATGGA GATCAATAGA GGCTCAGTTA CATAATGCTG GAGGAAGAGC TGCTGCTGTG 360
GGGGAGGGGC ACAGATATAC TGCACAGGAG AAGAGGAGGA GGAGGAGAGA AGGAAGAAGA 420
GGAGGAAAGA GGAAGAGGAG GAGAAGAAAA GGATGAGAAA AAGAAAGAAT ATAATAAAAG 480
AATATTGAAA AAAAGAAAAA GGAGAAAAAG AAAAAGGAAG TAGTAGTGGA AGAATAAGAA 540
AAGAAGATCA GTTAAAAAAA AGGGATGAAA GAAAGCTGCT GCTGCTGCGG GGAGGGGGAA 600
AGCTAGAGCA CAGGAGACGA GGAGGAGGAC GAGGAGAGGA GAAGAGGAGG AGAAGACAAC 660
TAAAGGAAGA GGAATGAAAA GAAAAAAAGA CAAAAATGAA GATGAAGCAG AAAAAAGAGA 720
AAAAGTTTAA GAAAATAAAA AATTCGAAGA AAAATTTAAA AAGAAAAGAG AAAAAGAAAA 780
ATCCATCTAT CCATCTATGT CTATCCATGT ATCTATCTCT ATGCACCTAT GTTTATCCAT 840
CTATCTCTAT CCATCTATGT CTCTCCATCT ATCCATCCAT CTCTATCCAT CTACGTCTCT 900
CCATCTATCC ATCTGTCTAT CAATCTATCC ATCTATCCAT CTACTTCTAT CCATCCATGT 960
CTATCCATCT ACATCTATCA ATCTTTGTCT ATCCATCTAC GTCTCTCCAT CTATCCATCT 1020
ATGTCTATCA ATCTATTTAT CTATGTCTAT CCATCTATCC ATGTCTATCC ATCTACATCT 1080
ATCCATCTAT ATGTCGATCC ATCTACATCT ATCAATCTAT CCATCTTTGT CTATCCATCT 1140
GTCTATCAAT CTATCCATCC ATGTCTATCC ATCTACATCT ATCAATCTTT GTCTATCCAT 1200
CTACGTCTCT CCATCTATCC ATCTATGTCT ATCAATCTAT TTATCTATGT CTATCCATCT 1260
ATCCATGTCT ATCCATCTAC ATCTATCCAT CTATATGTCG ATCCATCTAC ATCTATCAAT 1320
CTATCCATCT TTGTCTATNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1380
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNTC 1440
TATCCATCTG TCTATCCATC TAAGTCTATC CGTCTATCCA TTTACATCAA TCCATCTATC 1500
TCTATCCATC TATGTCTCTC CATCTATCCA TCTCCGTCTA TCCATCTATC CATGTCTATC 1560
CATCTACGTC TATCCATCTA TGTCTCTCCA TCTATCCATC TACGTCTATC CATCTATGTC 1620
TCTCCATCTA TCCATCTCCG TCTATCCATC TATCTCTATC CAACTATGTC TATCCATCTA 1680
CGTCTCTCCA ACTATCCATC TATGTCTATC AATCTATCCA TCTTTGTCTA TCCATCTATG 1740
TCTATCAATC TATCCATCTT TGTCTATCCA TCTATCCATG TCTATCCATC TATCCATCTA 1800
CATCTATCCA TCTATCCATG TCCACTATCC ATCTACATCT ATCCATCTAC GTCTCTCCAT 1860
CTATCCATCT ATGTCTATCA ATCTATCCAT GTCTATCCAT CTACATCTAT CCATCTATAT 1920
GTCGATCCAT CTACATCTAT CCATCTATGT CTATCAATCT ATCCATCTGT CTATCCATCT 1980
GTCTATCAAT CTATCCATCT ATGTCTATCC ATCTACGTCT ATCCATCTAT CCATGTCTAT 2040
CCATCTACAT CTATCCATCT ATGTCTATCC ATCTACGTCT ATCCATCTAT CCATGTCTAT 2100
CCATCTACAT CTATCCATCT ACATCTATCC ATCTATGTCT ATTCATGTAC GGTTATCCAT 2160
CTACGTCTAT CCATCTATGT CTATGCATCT GTCTAAAAAT CCATGTCTAT CCACCAGTCT 2220
ATCCATCCCA CCAATCATCC AC 2242