EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11147 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:59734387-59736489 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr3:59735951-59735964TAAAACACTTAAT+6.16
RREB1MA0073.1chr3:59735981-59736001ACCCAACACACACACACACA+6.71
SOX10MA0442.2chr3:59736411-59736422GTCTTTGTTTT-6.14
Enhancer Sequence
TGAAGACGAG AGCGCAGGTC TCCCAGCTTC AGGTAGTCGG GTCTGAAATC ATGACCCCAT 60
TGAGAGACAC AGTGAGCTTC ATCTACAGCC AGGTACCCCA GCAGACCCCG CGAAGACAGC 120
GAGCTCAGGA CGGGCTGGAA GGATGGAGAC GCCACCATCT CTGGGGTGAT GTAGAGCAGC 180
TTGAGCCGAG GAGTTTCGCT CTCCAGATCG GCCAGAATCT GGCGGCGCTC GGCCAGGGGC 240
AGTTTGGAGT TGATGGAGCG CGCTGGAACA TTCAGAGCTT TCAGGTGCTC CACTTGATCC 300
TGGAGCACAA AGAGCATTGA GGATGTTCAA GAGCTAGCTA TAAGCATTGC TAAAGCTGCT 360
GACAGATTAA TATACTGCTT ATCTGCTTAA TATGTGCATG AAAACTTTTC AGTAAGGGTG 420
AACCTTGATC ATCTGGCCTG CACAGAGTCC TGATCTCAAC CCAACTGAAC ACTGTGATGA 480
ACTAGAGCAG AATCTGAGAG GCGGGGCTTT CTTAACATCA GTACCTGACC TCATTAATCT 540
CATTAAAGTT TATGTGAAGG CAGGTGTCAC AAAAATTTTG CCAATATAGT GTATATTAGC 600
ATGTGTTTGG GAGATGGGGG GGGGGTACCT GAATGAGGGC GATCAGAGGA GAAATGACCA 660
GAGTGACTCC ACTGGCCATA AGAGCCGGCA GCTGATAACA CAGAGACTTG CCAGCTCCAG 720
TGGGCATACA CACAAACACA TCCCTGTCAC CTGAAAATAC ACACAAACAC ACACACACAC 780
ATCCCTGTCA CCTGAAAATA CACACAAACA CACACACACA CATCCCTGTC ACCTGAAAAT 840
ACACACAAAC ACACACACAC ACACACACAT CCCTGTCACC TGAAAATACA CACAAACACA 900
AACACACACA TCCCTGTCAC CTGAAAATAC ACACAAACAC ACACACACAC ACACACACAC 960
ACATCCCTGT CACCTGAAAA TACACACAAA CACACACACA CACATCCCTG TCACCTTAAA 1020
ATACACACAA ACACATCCCT GTCACCTGAA TATACACACA TCACTTTTAC CTAAAACACA 1080
CACACACACA TCCCTGTTAC CTAAAACACA CACACATACA CACACACACA CGTCACCTGA 1140
AAATACACAC ATCACTGTTA CCTGAAAAAA CACACACACA CACACACACA CATACCAGTC 1200
ACCTGAATAT ACACACATCT CTGTTACCTA AAACACACAC ATACACACAC ACACACACAC 1260
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC CCCTATCACC TGAAACACAC ACACATCACC 1320
TAAAATACAC AAACACAACA AACACATCCC TGTCACCTGA AAATACACAC ACACACACAC 1380
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACCCGA CACCTGAAAA TACACACACA 1440
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACAAACA CCTGTCACCT GAAACACAAC 1500
ACAAACATAT CCCTGTCACC TGAAAATACA AACATCAAAC ACACACAAAC ACATCATTGT 1560
CACCTAAAAC ACTTAATACA CACACATCCT TGTCACCCAA CACACACACA CACACACACA 1620
CACATCGCTC TATCCCTCTT CTCCTTCTCT AAGCCCATAT AAGTGCTCGT CACCCTGCAG 1680
CAGCGCGTTC ACGGCCTCCT CCTGCTGCCG AGAGCGAAAC TTCTCGAAGC CGAAGTGTGT 1740
CTTTAATGCT CGATGAACGA CACTCATAAC TACACGCACA CAAAGCACGC ACAATCACAA 1800
CATTCACACA ACTTTCACAC AACTCCCGGA GTCGCGCGCC GATGACGACA CGCAGCGCGA 1860
TAGCTGACGG GAAAATCCTG CGCGCGCCTT TCAGTTTTGT TTTGCAAATC GCTCGCGTTT 1920
TCTCATGCGG ACATCCAGAG TTTTTCAAAA ATAAGCACAT TTTCCCAAAC GAACGCGTTT 1980
CAGACAACTC CTCCATTTGA AAACAAACTA GTTTGTAGTT TTTCGTCTTT GTTTTATCGA 2040
TAAACCGAAT TGAAGGTGTC CATTTTGTGA CGTTTAGATT TGATTACTCA TTCATATATC 2100
AT 2102