EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11143 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:59351771-59353291 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESX1MA0644.1chr3:59352012-59352022GTTAATTGGT-6.02
Hmx2MA0897.1chr3:59352789-59352806ATTGATTAATTGATTGA-6.14
Hmx3MA0898.1chr3:59352270-59352287ATCGATTAATTGATTGA-6.08
Hmx3MA0898.1chr3:59352789-59352806ATTGATTAATTGATTGA-6.45
NFYBMA0502.1chr3:59352660-59352675CTGATTGGTTGATTG-7.19
PBX1MA0070.1chr3:59352163-59352175ATTGATTGATGG-6.62
PBX1MA0070.1chr3:59352278-59352290ATTGATTGATGG-6.62
PBX1MA0070.1chr3:59352366-59352378ATTGATTGATGG-6.62
PBX1MA0070.1chr3:59352460-59352472ATTGATTGATGG-6.62
Enhancer Sequence
TTCTTTAAAA GGACAGCGGG CGGTCAAAAG AAACTTTAGG TAAAATCAGA CAAATAAACA 60
GAGAAGTAGA TTGATTGATT GATTTGGTCT TTTAAATAGA TTGGTTGGTT CATTGGTCGA 120
TTGGTTGGTT AGATGGCAGG TTGATTAATT GATTGCTTAA TTGGTTGAAT CTTATTAATG 180
GATTGATTGA TTGATTGATT GATTGATTGA TTGATTGATT GATTGATTGA TTGATTGATT 240
GGTTAATTGG TTGACTAGTT AAACTAATTG ATTAGTTTAT TAATTGGTTG ATTGATTAAT 300
TGGTTTAGTC TTATTGATTG ATTGATTGAT TGATTGATTG ATTGGTTGAT TGATTGATTG 360
ATTGATTGAT TGATTGATTG ATTGATTGAT TGATTGATTG ATGGCTTGTT TGGTTAATCG 420
TATATATTAA TTTAATGGTT GATTGAGTGG TTTAGTCTTA TAAATGGATT GATTGGTTGG 480
TTGGTTAAAT GGTTGGTTGA TCGATTAATT GATTGATGGC TTGTTTGGTT AATCATATAT 540
ATTAATTGAT TGGTTGATTG ATTGGTTTAG TCTTATAAAT TGGTTGGTTG GTTGGATTGA 600
TTGATGGCTT GTTTGGTTAA TCATATATAT ATTAATTGAT TGGTTGATTG ATTGGTTTAG 660
TCTTATAAAT TGGTTGGTTG GTTGGTTGGA TTGATTGATG GCTTGTTTGG TTAATCATAT 720
ATATTAATTG ATCGGTTGAT TGATTGGTTT AGTATTATAA ATTGATTGAT TGATTGATTG 780
ATTGATTGAT TGATTGATTG ATTGATTGAT TGATTGATTG ATTGATTGAT TGATTGATTT 840
CCATAGATTA ATTGATTCTC ATAGATTGAT TGATAAGTTG GTTGGTTGAC TGATTGGTTG 900
ATTGATTGGT TTAGTCTTAT AAATTGATTG ATTGATTGAT TGATTGATTG ATTGATTGAT 960
TGATTCCCAT AGATTGATTG ATTCTCATAG ATTGATTGAT TAGTTGGTTG ATTGATTGAT 1020
TGATTAATTG ATTGATTGAT TGATTGATTC CCATAGATTG ATTGATTCTC ATTGATTGAT 1080
AAGTTGGTTC GTTGACTTGT TGATTGATTG ATTGATTGAT TTAGTCATAT AAATTGATTG 1140
GTTGATAGAC TGAATATTAT CTTCTTCGTC TTCATTTTAC TTCATCTCCT ATAAAATTTT 1200
TGTCCAGCCA CTCTGCCATA AAGTCCAGAC TGGAGGAGTG TCGAAGAGAC GGCTGTCCTT 1260
CTGCCAGTTC CTCCACCAGA CCGTTTGATC CACTGCTGTT GTGAAGGCTT CTCTGTTCTG 1320
ATTGTTCAGT TTCACTGGAC AAACAGCTCA AGGCTGAGTC CTGCTTCTTC TAAACCTCTT 1380
CCATTTCACA AGCTCACACA TGCAAAATTC AGATATCTGA CATGCTGTCC TGTGGGAGGG 1440
CTCCAAGCTA GAATTTGGCC CGAACTCTGC CTCGCATCCC AGACTGATAG ACTGAAAGTC 1500
CAGAGAGTTG ATGTGGGATG 1520