EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11131 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:58188885-58189991 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr3:58189580-58189601GGAATGAAAGTGAAAGTGCCA-7.4
PHOX2AMA0713.1chr3:58189791-58189802TAATTAGATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr3:58189791-58189802TAATTAGATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr3:58189791-58189802TAATTAGATTA-6.32
Enhancer Sequence
GCGTTTTGCG ACAGGATAGT CCACACACAC ACAAACACAC AGCTTTTTGA CACTCTTTGC 60
ACCTACCGAG TCAGTGCAGA CCATAGACAC CTGCCTCGTG AAATGCGGAT CTTTTTTTTT 120
CTTCTTCCAT TCAGCATGCG GTATGAACTA GAGGTCTGCA TTCCCGTGGC TGTTCTGCGG 180
GACCCGACCA GATTTTTGCG GCGCGGGATT CTGAATAAAG CGCGGGAGCG GTCGGTAACG 240
GGTTTAATTT GGGACGTCTA GCAATATCGC TCTCGACTCC TGAGCGAGCG AGCACGCGCA 300
TGTATATGAT TGAAACTGCG CGATGCTGTG TTTAGCTTGT TTGTTGGTGT GTGTATGTGT 360
ATGTATATGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTTAT ACAGACAGCT TGTTATAGGC 420
AGTCTGGACT CTGTATAGCT GTGTGGTTTT CGGTTTTGTC CTCCGCCCGC TCTTTAGCGG 480
GATTGGTCGA GGTGGGTAGA AAATGGGGTG GGTCGTGCCG CGGGACAACA AATGCTGAAT 540
TAAAGCGGGA GCGGTCAGGT TCGGGCTAAA AACTGGCGGG GGCGGGATTC AAAATTTAGT 600
CCTGCGTACA TCTCTAGTAT GAACTTCCAT TAAAACATCT CTTCCAGCAG TTCATAGTTG 660
CATCCAACAT CTTGTTTGTC AGGGGGGGGC ATGCCGGAAT GAAAGTGAAA GTGCCAAACC 720
TGCAGTTAAA GTTGACAAAT TAATAATGAA ACACCCAAAA TTACATGAAA CTCTGGAGGA 780
AATGCGGATA GCGCTGTTAT GCAATGACGT TAATTAACTA AGTATGTGCT ATAACATGTA 840
AAACAGGATC ATGAAAGAAA CCTTCAAAAT GCAACTCATA TAAACGCTTT AATCTTATTA 900
TTGTCTTAAT TAGATTAAAG CAACTAATTC GATTACTGAT GTCCATGTAA ACGTAGTCAA 960
TGGTGTAAGC TCATATGTAT ATTATATAGC GCACTTCCTA TATACAACCT TTTATTTTGT 1020
TTCTTTAAAT AAGTTTAATC TTTCAAATAT AAATATTTCA AATTACCATG CTGTTTTCTC 1080
ACAGTGACCC ACCGCCTCTT TATTCG 1106