EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11117 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:56955773-56956883 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr3:56956336-56956347TGATTAAATTA-6.62
DUX4MA0468.1chr3:56956451-56956462TGATTAAATTA-6.62
DUX4MA0468.1chr3:56956566-56956577TGATTAAATTA-6.62
DUX4MA0468.1chr3:56956681-56956692TGATTAAATTA-6.62
DUXAMA0884.1chr3:56956450-56956463TTGATTAAATTAC-6.74
DUXAMA0884.1chr3:56956565-56956578TTGATTAAATTAC-6.74
DUXAMA0884.1chr3:56956680-56956693TTGATTAAATTAC-6.74
DUXAMA0884.1chr3:56956335-56956348TTGATTAAATTAA-7.34
ETS2MA1484.1chr3:56956089-56956099GACCGGAAGT+6.02
Enhancer Sequence
CAACAGAGAC AGCGCGCAGA AGTATAAATG CACAGCCACG CGTGTTGCAT GTGCCGTAGG 60
TTACGCCGGT CACTTGACGC AGAAGTATAA ATCAGGCTTA AGGGTACTGT TGGCAGTGGC 120
AAAGCAAGAA TGTTTAGCGA GACTACTTAC TACTCACTGT GTTTTCACTG TGGTGTTAAA 180
AATGAAAAAT AAAAGAGGAC AGATTAAACA AATACTACAA AACTGCACAA TACACATCAA 240
GCACAAAGTT GTTCTTGCCC ATGGGGAAAT ATAAATATGT TCATATGTGG GTTGTTGCTA 300
GAAGGGATAC AGTTGTGACC GGAAGTTAAT GAGAAGTATT TGTATTATTT GTTAAATTAC 360
CTATTAATTG TATTTTATTA ATGTCCACCC CTACTCCAAC CACCACAGTA ATGTAAATAC 420
AGTCATTTTT CTGAGTATTA TTCATATTAT CTATTAAATT ACCCATTATA TTGTATTTTA 480
TTAGTCTACT CTTACACCAA CAATAAACCC AACCACCACA GTAATGTAAA AACAATTATT 540
ATACTAATTA TTATTCATAA TATTGATTAA ATTAACCAAT TAAATTGTAT TTTATTAATG 600
TCTACTCCTA CATCAACCCT AAACCCAACC ACCACAGTAA TGTAAAACAG TTATTATACC 660
AATTATTATT CATAATATTG ATTAAATTAC CCAATTAAAT TGTATTTTAT TAATGTCTAC 720
TCCTACACCA ACCCTAAACC CAACCACCAC AGTAATGTAA AACAGTTATT ATACCAATTA 780
TTATTCATAA TATTGATTAA ATTACCCAAT TAAATTGTAT TTTATTAATG TTTACTCCTA 840
CATCAACCCT AAACCCAACC ACCACTGTAA TGTAAAACAG TTATTATACC AATTATTATT 900
CATAGTATTG ATTAAATTAC CCAATTAAAT TGTATTTTAT TAACGTATAT CCCTATTCCA 960
ACTCTAAACC CAAACACCAC AGTAACGTAA AAACAACAAC TATACCAATT ATTATTCATA 1020
TCATTTTTTA AATTACCCAT TAAATTGTAT TTTATGTCTA CCCCCTACCC CAACCATAAA 1080
AATTCAATGT CACAGTAATG TAAAAACATT 1110