EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11082 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:53147041-53149203 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BARX2MA1471.1chr3:53147809-53147821GTAATGATTTTT-6.37
DMRT3MA0610.1chr3:53147150-53147161AATGTATCAAT+6.62
DMRTA2MA1478.1chr3:53147150-53147162AATGTATCAATT-6.92
DMRTC2MA1479.1chr3:53147150-53147162AATGTATCAATT-7.22
Foxd3MA0041.1chr3:53147542-53147554GTTTGTTTGTTT+6.32
SOX10MA0442.2chr3:53147320-53147331TTCTTTGTTTT-6.62
ZNF384MA1125.1chr3:53148200-53148212TTTTTTTTGAAA-6.18
Enhancer Sequence
ATGTTGTTTT TTTCTTTGTT ATGCCCAAAT ATTACACTGT GTTGTGAGAA AACACTATTC 60
CTTTCTGACA AAAAGGCACA AAACAAAATT CTTTTTAATA TTAATTGTAA ATGTATCAAT 120
TCAGTTCAAC GGTTTTACTT CTAAATGGAT TATAGGCTCG TCCAGTGTAG TTTTTGTTTT 180
AATCAAATAA CGTATAATTG AAACAAACAA AAAAAATTAT TGTTTTTTGT TTCACTTAAT 240
TTTTAAATGA TTTTATTTGC TTAATTTTTT CTTAGCTTTT TCTTTGTTTT TGTTTGCTTT 300
TTGTATTTGT ATTTTTGGTA TTGTTAAAGC AGTGCAGATT TAAATTTAAA CCATCTACTG 360
TAAATATAAG CATGTTTTGT TGTGTTTTGT TTTGTTTGGT TTTACTGTGT TGGGTTTAGT 420
TTTATTGTGT TTTGCTTGGT TTTGTTTTGT TGTGTTTTGG TTTGTTTGGT TTTGTTGGGT 480
TGGATTTTGT TATGTTTTGT TGTTTGTTTG TTTTAGTTTA TTTTGGTTTG GGTTTTGTTG 540
TGTTTTGTTT GATTTTATTT TTTGGTTTTA GTTGGGTTTT GTTGTGTTTT GGTTTGGTTT 600
TAGTTTGGTT TGTTGTGTTG CGTTTTGTTG CTTTGATTTG TTTTATTTGG TTTTGTTGTG 660
TTTTGTTTGG TTTTGATGTG TTGTGTTTGG TTTTGTTGTG TTTTGGTTTG TTTGGTTGTG 720
TTGGGTTGGA TTTTGTTGCG TTTTATTGTT GTGTTTTCAT TTAGTTTGGT AATGATTTTT 780
TTTTGCTGTG TTTTGTTTGT TTTATTTTGC AACAGGGGGT CGGTTCTTCG TACATGGATT 840
ACTCAATTAT CTGGATTTGG TTATTGACAA TTTGACATGA TCCAGGATTG TTTCGTTCCA 900
ACTTGCTAAG GAGCAGGCTC ATTTCATATA AACAGGATTA GGTCGGATCA TTTCAAGCAA 960
AGATAATACT GAATGTATGT ACCGAATGTA CTGAGTATGT ACACTTTGGA AAATAAATAA 1020
TATATGTATT AATAAAACTT ATGCAATCTG CATTCCGAAG TGAAAGTACT TTGGTTCAAA 1080
GAAAAAAATT ATTGATATGA ACTTTTTAGA TCACTTTAGT ACAATTTGTG CATGATAATA 1140
GACATGCAGA ATACGTGACT TTTTTTTGAA AGCAATAATA GCAAACAAAC AATAAAACAA 1200
ATAAAATCAT AACAAACAAT TAGATAATGT CATTACGCTG CTTTACCATC AGCCAATCGT 1260
TGCATTGCTG ATCATAAATT CAAGGATCAA TAGATCTGTT CTTTCAGCAC ACACAGTGGT 1320
CTCAGATCAG TTCTTCCAGA CACAAACCTG TTTGAAGAAC CAAATTAGAG ATCAGTTATC 1380
ATGATTAAAA GATCCAGTAT CTGCCAAATC ATCTTTAATC ATTTAAGTGA GGTACTGTAC 1440
GAAGAACGCA CCCAGGGTGT CTCATAATGT TTTGTTTTTT GGTTTGGTTT TGTGTTCTGT 1500
TGTGTTTTGT TTGGTTTTAT TTGGTTTTGT TTTATTTGCT TTTGTTGTGT TCGGTTTTGT 1560
GTTTATTTAT TTATTTTTTG GGGTTTGTTT GGATTTGTTG TGTTTTGCTT TGTGACAGGG 1620
TGTCTCAATG TTGTTTTGTT TTTTGTTTTG GTTTTGTTGG GTGTTTTGTT TGGTTCTATT 1680
TGGTTTTGTT GTAATATATA TATTTTTTTT GATGGGTTTT GTTGTGTTTT GTTTTGCAAC 1740
AGGGTGTCTC ATAATGTTTG ATTTGATTGT AATAAATTTA AAAATGGACA AATCATTTTG 1800
GAGCCTAAAA AACAGCAATG CTGCAATTTC TTTTGCACCA TTTTCCGCAG TGACCCAATT 1860
CCTTTTTGTG TCTCGCCCCC CTTACACCCT ATTTAAATTC AGTGTATTAG TTCCTGCATC 1920
AGTTCTTTAC CAGCCCGTCT CTGAGGATGT TTGATAATGT GTGCTGCTGG AGGCAGGCGA 1980
ACATTCAGCG CTCTGCCTTC TCTCAACTCT CCTACTAGTG ATCTCTGGGT TCAACTGGTG 2040
CTGTCTGGCT GCTTTGGGTG CGATTCCCAG GCCTGGCTGT GGGGGCGGCG GCTGGATGAC 2100
TGACTGACTG AATGACTGAC TGCTGTAGCA GCGTCCTGAA ACTGGGTCAT GATGTAGTGT 2160
TA 2162