EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11079 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:52785280-52785700 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Dlx1MA0879.1chr3:52785333-52785343GATAATTAGG-6.02
HOXC11MA0651.1chr3:52785457-52785468GGTCGTAAAAA+6.32
HOXC12MA0906.1chr3:52785457-52785468GGTCGTAAAAA+6.62
HOXD10MA1506.1chr3:52785457-52785468GGTCGTAAAAA+6.14
HOXD11MA0908.1chr3:52785458-52785468GTCGTAAAAA+6.02
HOXD12MA0873.1chr3:52785457-52785468GGTCGTAAAAA+6.14
Enhancer Sequence
CTCCAAATGT TGCTGGTCAT TTGTGTAATT ATCAGTAATC ACAGCTTAAT TGAGATAATT 60
AGGCTGAAGA AAAGGCTGTA TGCTTGAGGG ATTGGGCTGG AGGCGGCTCT TAATGGATAT 120
TGTGGGTGAT ACTCTTTGGG GAGGTGGTAA ATTTCACTCT ATTGATTGTG GGGCTGTGGT 180
CGTAAAAACA ACAGCCCTCC CCTCACCCTA CGCACACACG CACACACACA CCACACAAAC 240
AACCACACGG TGAGTCTGGA TAACAGGACA GCAGAAGTGT TGTTTTAAGT TTAGGCTTGA 300
CACATTCTCA ACACTTTGCA GGCAGGCGAC AAGCTCTTGT TGTTAAAGTG GCACTAAAAT 360
CAGTTTGGTG CCATATTAAA TGTGCCGTTT CACCTGATAA TAGTCACAGT AATTAGCTTG 420