EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11066 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:51546158-51547872 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr3:51546937-51546952AATTAAACAAACAAA+6.26
Foxd3MA0041.1chr3:51546677-51546689AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:51546681-51546693AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:51546710-51546722AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:51546714-51546726AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:51546782-51546794AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:51547329-51547341AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:51547333-51547345AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:51547337-51547349AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:51547341-51547353AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:51547569-51547581AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:51547345-51547357AAACAAACAATC-6.92
Foxj3MA0851.1chr3:51546544-51546561TTGTTTGTTTATTTTGT-6.12
ONECUT2MA0756.1chr3:51547318-51547332AATAAATCAATAAA+6.29
ONECUT3MA0757.1chr3:51547318-51547332AATAAATCAATAAA+6.71
SOX10MA0442.2chr3:51547560-51547571AAAACAAAGAA+6.62
Enhancer Sequence
ATTTAAAGAA ATGTATGTGT GTGTAGAATG AGATTAAGGG CCGCAGTGTC TGTATGTGTT 60
TGTAGTGCTG CATTGGTTAT TTGTGCATGA TCAGTCAAGA GATCAGCCTG ATTAAGCAGT 120
TAAGCTGGTT TAGCTGTCCT GCTATGTGCC TGCAGACTAA TAAGTGAGTC TGAATGTTTG 180
TCTTCATTCT GCACTAAATG CATGTTTAAT CAGACCTCTG ATTGTCTGCG TATTATGTTG 240
GCTTGTTTCA GCTTGATTAA TCACAATCAA GCCATTGAAG TCATTCTGAT TATTATTTTG 300
AAAATCACAG AATAATTGTG CCCAAATTGG GTCTTGCTTT TATTTTTGTT CCTATCGTTG 360
AAGTGTGTGT TTGCTTGTTT ATTTATTTGT TTGTTTATTT TGTTAGTTAG TTAGTTAGTT 420
AGTTAGTTAG TTAGTTAGTC AGTTAGTCAG TTAGTCAGTC AGTCATTTAG GCTGGTGCTG 480
TTTATATTGA AATCAAAATT GCTTAATGCA ACATTCCACA AACAAACAAA CAAACAAATG 540
AACCAGCAGA ACAAACAAAC AAACAAACAA ATTAATAAAT AAATACATTG TCAATGCATA 600
AACAAGCAAA ATAAATAACC AGCAAAACAA ACAAACAAGC AAATAAATAA ATAAATAAAA 660
TAACTAACTA ACTAACTAAC TTACCGACTA ATTACCAATA CATAAGTTAA ATACATAATC 720
TAAAGTAATC AAACGAACAA ATAAGCAAAA CAAATGAACC AACAAGCAAA TAAATAAATA 780
ATTAAACAAA CAAATAAATA CATAAATACA TAAGCAAAAT AAATAAACCA GCAAAAGAAA 840
GAAAGAGATA GAAAGAAATA AACCAGCAAA ACAAGCTAAT AAATAAATAA ATTCATAAAC 900
CAACAAAACA AACAAAAAAT TTAGAAATTA TCAATACATA AACAAGCAAA ATAAATAAAC 960
CAGCAAAAAA CAAGCAAGCA AATAAATAAA TAAACAGACA GACAGACAAA CTAACAAATC 1020
CAAAAAATTA TCAATACATA AACAAGGAAA ATAAATAAAC CAGAAAAATA AACAAGCAAA 1080
AAATGAAACG GCAAAAACAA ACAAGCAAAT AAATAAACAA GCAAAATAAA TAAACTGGCA 1140
AAACAAACAA GCAAGCAAGC AATAAATCAA TAAACAAACA AACAAACAAA CAAACAATCC 1200
AACAAAACAA ACACACAAAT ACTTTAATGA ATTATCAATA CATAAACAAG CAAAAAAAAT 1260
CAGCAAAAAA AAAACAAGCA AACAAATAAA TAATAAATAT ATGAACCAGC AAAAACGAAC 1320
AAGCAAATAA ATAAGCAAGC AAAAAAATAA ACAAGTAAAA TAAATAAATC AGCAAAACAA 1380
GTAAATAATT AAGTAAACCA AGAAAACAAA GAAACAAACA AACAAATGCA TGAATAAATT 1440
ATCAATGCAT AAACAAGCAA AATAAATGTA CTAGCAAAAA CAAACAAGCA AATAAATGAA 1500
CCAGCTAAAT AAATGAACCA GCAAAATAAA TAAACCAGCA AAACAAACAA ATAAATGAAT 1560
AAATTATTAA AACATAAACG AGCAAAGTAA GCAAACCAGC AAAATAAATA AATAAATAAA 1620
TTATTATTTT CCTAATATAT CAGATCATTT TTACCCTTTT TAATACAACG CCAGATTAGT 1680
TCAGGTTTTG AAATGTCAGG TGGCATAATT ACCA 1714