EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11051 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:50202317-50202993 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr3:50202325-50202336GTTTTAATTAA+6.14
RARAMA0729.1chr3:50202727-50202745GTGGTGAAAAGGTCATTC+6.7
Enhancer Sequence
TAAATTGTGT TTTAATTAAC AATTATTTGG GTACAAACAT GTGTAACATT ATACAGTATG 60
TCTGCTTGTG TTTCATAGAG GAAAGTGATC AGCATATGGG TTTGGACATG AAAGTAATTA 120
AAGAACATCT CTGAAAAAAA CAATTTCTTG AAAGGCTTTT TTAGGTGGAC ATGTTTACAA 180
GGATTTGCAT GTGTTTGGAA AGCCAGGGGG TTTATATCAT CACCGGATGG TTTGGAGCAA 240
AGTGTGATAA ATGCGAGCCA AGACACAATA ACTGTGTGGT GAACCATGCA CAAGACAGCT 300
AGATGCGAAC CCTGTTTGTG TGTTGTGTGT TAGCAGTCTC AGTGTGTGTG TGTGTATGGT 360
GTGTGTTTGC TCAGTGTTGA AAGGCCGTTT GAGTCAACAT GCAGCTGTCA GTGGTGAAAA 420
GGTCATTCAT TTCTCTCTCT TCTGGTTTAC AAACGTACCG CTACCCTGCA CATTCAGCAC 480
CTCCTTCCTA TTTACCTCAG AACAAGAGAA CCCATACACA ACATGGTGTT TAATTAATCA 540
GCACTTTGGG AATACCATCC TGTCAACAGC TGACCAGAGG CACAAACGCT GCACCATCAA 600
ACCTCTTATT TTCCAATTTC CTACTTAAAA AAGTCATATA ACTTTTATAT TTTGTAGCAT 660
TTGATATTTT AACCCC 676