EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-11033 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:48377167-48378681 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr3:48378603-48378614TTAATTAATAT-6.62
EsrrgMA0643.1chr3:48378227-48378237TCAAGGTCAT+6.02
IRF1MA0050.2chr3:48377904-48377925GGAGAAAAAGTGAAAGTGAGG-7.05
PRDM1MA0508.2chr3:48377913-48377923GTGAAAGTGA-6.02
RORAMA0071.1chr3:48378226-48378236ATCAAGGTCA+6.02
ZNF263MA0528.1chr3:48377782-48377803TAAGGAGGAGAAAAAAGAGAG+6.24
Enhancer Sequence
AGTTTTAAAG TAATCTTAAG GTTATTTATT TATTTATTTA GTTATTTATT CATATTGGTT 60
CTAGAACAGA ATTAAATCTA AAATGTGTTT TGCATTCATT TGTGAATATA CATCCTAATG 120
TTGATGTGTA ATATATGAGC GTCTATCTCT GAGAATATGA TAAGATAGCA AGTTTGATCA 180
ACCTTCACTG AAATACATGG GGTTAACAAG TTTGGTAGGT GTTCCTACAT GATTGGTTTA 240
TATGCGTGTA GTCCCGCCCT CTGGTGTGGA GTGTGAAATG TGATTGGCGG TTGGGAACAG 300
AGAGCGGAGA GAGGAGACAC AGCCGGCAGT TTTGGAAACT GAAGGGGAGA CTCGCGTCGC 360
GGCTGTTTTG ATTGCGTAAC ATTCACGGAG TATAAAAACA AGTGAATATA TATTGCGTGT 420
GAACAACACG TTTTTGATTA CTTTGAGTTT GTTTTGTGTT TGTTTTAAGT TCGCGGTGTG 480
TTTTCATCAT ATAAGTTTCC AGTGTCAGTT ATTAGTCAGT TCAGAGTGAG TGAGCATTTT 540
TTAAATGCCT AGATTGTCAA CTGACAGTTA CAGAGGACTA AAGCTGAACT GAGAGAGAGA 600
CGGTTAAACC GAAAATAAGG AGGAGAAAAA AGAGAGACTG TTAGATTAGC ATGAAACAAC 660
GTTGAAAGAG TCAAAGAGGA GCAAATAGCA CCACAAATAG CCTGAATACT ACATGAGATT 720
TGCCTCTCAT CAGCTGGGGA GAAAAAGTGA AAGTGAGGAT TTGAAAGACC CGCGGCAGAA 780
GTTCGCCGAT CGATCGCGGC TCGTTGGCCC GTTGTTCACA AGTGTTGTCA GTTTGGAGAA 840
CTGTCATATA TTGCTGTCAT CTGGATCACT GTCAACTGGA TCTCTGTCAT CTGGATCGCT 900
GTCAACTGGA TCGCTGTCAT CTGGATCGCT GTCAACTGGA TCGCTGTCAA CTGGATCGCT 960
GTCATCTGGA TCGCTGTCAT CTGGATCGCT GGCATCTGGA TCGCTGTCAA CTGGATCGCT 1020
GTCATCTGGA TCGCTGGCAT CTGGTTTGCT GTCATCTGGA TCAAGGTCAT CTTCATCTGA 1080
GGTATCTTGT TTAATTTTAT TTGTGCTCAG GAGAGTGAAG AGGCCATTTT CATTTTCCCG 1140
GCCACAACGT ACACTAGCAG CGATACAGGC CTGCAACGGG GGGTGTATGA ATGTGTGAGT 1200
GTGTGGGCCC ACAGAGTATT GAGTTGTTTA TGGAGATGCA GTGAGCATAA AATACTGCTG 1260
CGTGTTTTAC AGTATAGATT TATACTAATA GTTTATATAG GGTTAATTCA GTGTGTAATT 1320
TAGTGACACA ATTGTAGCCA CTTTCAAAGA GAAACATATT CAGTCACTCT TAGCCACTTG 1380
TTGATTTATA AGTTTAATTG TTAGAGTGTA GAAAGGTGGT ATTTTTCTAT ATTGGTTTAA 1440
TTAATATTCT TCATTGTACT GTAAATTGCT GGGTTTGACT TTGGGTCATT TTACTGTCTT 1500
TTAGCTGTGC ATAA 1514