EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10997 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:42969764-42971227 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr3:42971111-42971128CACAATTAATTAATTCA+6.11
ArxMA0874.1chr3:42971112-42971129ACAATTAATTAATTCAT-6.59
ESX1MA0644.1chr3:42970630-42970640ACCAATTAAC+6.02
Hmx2MA0897.1chr3:42971014-42971031TCAATCAATTAATCAAT+6.14
Hmx3MA0898.1chr3:42971014-42971031TCAATCAATTAATCAAT+6.45
Lhx3MA0135.1chr3:42971114-42971127AATTAATTAATTC-6.29
PBX1MA0070.1chr3:42970787-42970799CAATCAATCAAA+6.18
PBX1MA0070.1chr3:42970858-42970870ACATCAATCAAT+6.44
PBX1MA0070.1chr3:42970425-42970437CCATCAATCAAT+6.62
POU6F1MA0628.1chr3:42971115-42971125ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:42971115-42971125ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr3:42970954-42970974CACCCAACCAACCAACCAGC+6.28
Enhancer Sequence
AACTAAAATA AACACATAAA ACTTTATGTC CACGTCTTTG TTGCTTTATC AGCCCGAGGT 60
TACAGGAAAT TTAAATTGTT TGAAGTTTTG CCAAATTAAC TCGTATCTCG TAACTCTGAG 120
ATTTACAAAA TCGTAAATTT GTACAGTTAA ATATATGTAT GAGAATAAAA TGTATGATTT 180
AAAAAAAGAC CAGTTTATTT ACTTTAAGTA TAAAATATCT ACTAGGCTGC ACTATTCATG 240
TGCTATGCCT TTTTACTCTT CACACTTGAA ATGATTTAAT AAAGTATTTA GCAAATAAAT 300
AATCACTTAT TGTATATTCT ACAACTCCAT TTTAATTACA GAAACACTGT GTATGAGTGC 360
CATTTTCTAA AGTTTTAAAG GCCAATCGGA TCAATCAAAC AATCAATCAA TCCACCTGCC 420
AGCTTGCCAA CCAACCAACC AACTAACCAA CCAACCAACC AACCAACCAC TCGATATCAA 480
TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA 540
TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAACC AATCAATCAG TCAATCAATC AATCAATCAA 600
TCAATCAATC AATAAGTCAG TTATTCAAAC CTCCCACCCG TCCACGAACC AATCCACAAA 660
CCCATCAATC AATCAATAAA TCAATCAATC AGTTATTCAA ACCTCCTACC CACCCACAAA 720
TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA 780
TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC AGTTATTCAA ACCTCCCACC CGCCCCAAAC 840
CAATCCACAA ACCTATCAAT CAATCAACCA ATTAACCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT 900
CAATCAATCA ATCAACCAAT CAATCAGTCA TTTATTTAAA CCTCCCACCC GCCCCAAACC 960
AATCCACAAA CATATCAATC AATCAACCAA TCAATCAACC AATCAACCAA TCAATCAATC 1020
AATCAATCAA TCAAAAGCCA ATTCTAAATA ATTTTTACCT CACAATGATT GATGTCCATC 1080
GACCCTTGAG CATGACATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA 1140
ATCAATCAAT CAATCAATCA ACTCTCTCAC TTACCCACCA ACTAAACCTT CACCCAACCA 1200
ACCAACCAGC AAACATACTA GCCAGCCAGC CAGCTAGCCA ACCAACCAAA TCAATCAATT 1260
AATCAATCAA TCAATCACTC AATCAATCAA TCAATAAATC ATGGGCCTGA TTAATCTACT 1320
TGTTTGCTTG CTTTAGTAGA GTACGTGCAC AATTAATTAA TTCATTCCCT TTGATTTACT 1380
AATTTGTGCG TACAATTTGC TAGTGTGTTG TCGTGTTTTA AGAAAATTGT GTGCCCTTGC 1440
TAATAATAAA TTGTGCTCTT GTT 1463