EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10955 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:39614746-39615442 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PBX2MA1113.1chr3:39614941-39614953ATGATTGACAGG+6.74
PBX3MA1114.1chr3:39614939-39614956GGATGATTGACAGGTCG+6.11
Sox3MA0514.1chr3:39615318-39615328CCTTTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
GATAGAAGGA AGAACGTTTC ATCCAATCAC TGAATGGTCT GAAAGATCCA TATTACACAA 60
AATGTCAAAA GAGACTAACA GGAAGAGAAA ATATTGAATC CTTAAAATTC TGCAATCGTT 120
GCGAATGACT TGGTGTGGTA AAAGGGATGG AGTGAAGGAG CTAATGGAGG CAAGGCGGGA 180
TTAACCACCC AGGGGATGAT TGACAGGTCG ATGGTGCTGC TTGCATTCCC CCGTCTGTGA 240
ACTCACAGAT ATTGGAGTGG CTTTAGTTGA CGCAGCACAA CTGTTGGATG ATCACCAAAC 300
TGTGAAAACC CCTTGGCCTC AACAATCATC AAATCCATTT CAGTGTAATT TAAGACCCAC 360
ACCTGTTTCC AGACTGTCGA TAGCGCTTTG GTCTTTATCT TCCTCAATTA AAGAAGGGAT 420
GGTGTAGAGA TTGACACAGT TAGCGAGTCA TACATGGCTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 480
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGGT 540
TATGTACAGT TGAAGTCAGA AATACTAGCC CCCCTTTGTT TTTTTTTCTC TTTTAAATAT 600
TTCCCAAATG ATGTTTAACA GAGCAAGGAA ATTTTCACAG TATGTCTGAT AATATTTTTT 660
CTTCTGGAGA AAATCCTATT TGTTTTATTT TGGCTA 696