EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10870 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:32259667-32261023 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC1MA0032.2chr3:32260985-32260996TAAGTAAATAT+6.14
IRF1MA0050.2chr3:32260196-32260217TCTTTTTTTCTCTTTCTCTTT+6.21
IRF1MA0050.2chr3:32260202-32260223TTTCTCTTTCTCTTTCCCTCC+6.46
Enhancer Sequence
TTGTACAGGG AAGTGAGTCA GCAAATACAG AACAATCCCT GAGAAAACAA CCACCCACTG 60
CACACATCCT GATTCAGATG CTTTCTAATG AGACCTTTAG CTCTTCAGCA TTTGCTTATT 120
AAAGCCAACT TCAATGTCAT GAATGCTTTC TCTTTCAGTC CACTCCGTCC CCATCTGCTG 180
ATCTGCTGGG GCTCCGCACA GGTCCCCAAG TCAGTGCCGC CCCTCCCAGT GCAGGCAGCT 240
TATTGGTTGA TGTGTTCTCG GAGGCTGGTG TCAATGATGA TGGCTTCCTG AGGTAAATAA 300
GCATCTGGCT CATTACGATC CAGTCTTTTG TGCATTATTT CTTGAGCTGT AAAGTACACT 360
AATATTTTAA CCTGTTCAGA GCTATATATA TACGTGTCCG TCAGGCTTTC TGCTCTTCTG 420
TGGTTGCACT TTCTCTATTG CTTGTTGTTC TTGTCTTCCT CTTTGTCTGT TCTGTAATCT 480
TGTGTCTTTT ATCTTGCTGC GTATGTGACT GTCTTTCTCT TTTCTTGCTT CTTTTTTTCT 540
CTTTCTCTTT CCCTCCCATT TCCATCTCCC TCATTTTGGT GTGTGTGTGT GTGCGTGCAC 600
ATGTTTGTGT GAATGTGTGT GCACGTCTGA CGTCCTTGCT TTTCATTGGA CTATGGCAGA 660
GATCTGGAAC CTCCCACTGA AAGCTCTGAC TCCCTATTGG CTGAGGGTCC TGGTGACTCT 720
GAGTAAGGGG CCAGTGGTAG ACTACAGTGG CAATATGTTA TTGACATTCA ATAGTCACAT 780
GATGTTGTGT AAATGTTGTG TTGTTTATAT CTGTGGTGTA TTTTCTATTT GTCTGCTGTG 840
TGGTGGTGAT TTTTGAATTG CTAACATTTT ACCGGCTGCT AATGTAATGC CTGTACTAAC 900
GTCTGCCTTC TCTTTTTATC CCCTCTTTTG CCTTCCTACT TTGGCTTCAC TCTCCTCTAT 960
TTACGTCTCA CCACTTTCTA ACCTCCTTGG TCTGTTTTAA TCATCTGTGC CTTTTAACAC 1020
GTAACACTTC TCACCCATGA CTACATCTTT CTGGGGTCGC TATGTCTCTC TGCATCCTTC 1080
ACTTTCGGTC TCTCAGCTCT GCTCCTCCCT CTGCGGTCTC TGAAGATGCT GCTCCTCCTC 1140
TGCCTGAGTC AAACGAACTG CTCAACAAGT AAGAGCTCAC TCGTCTACTT TACACCCATC 1200
ATCCGAAGAC TTTCTAATTA TGCCCCTCTT CTCTACAAAT TCAGCTAAAA AAGTGACAGT 1260
AAATGCATTT ATTATCCTAC AGATGATTTC CACTTCAGAA TTTTTTTAAT TATTATTTTA 1320
AGTAAATATT AAAGGGAAAT GAAACTTTGC TGTTCT 1356