EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10751 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:21210789-21212367 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GFI1MA0038.2chr3:21210813-21210825TGCTGTGATTTG-6.52
Gfi1bMA0483.1chr3:21210813-21210824TGCTGTGATTT-6.62
HOXD9MA0913.2chr3:21212139-21212149GCAATAAAAC+6.02
SOX15MA1152.1chr3:21211055-21211065AAAACAATAG-6.02
Enhancer Sequence
TTTCGAAGCT TGTTTGACCA CACATGCTGT GATTTGCAAT TCTTGGAGCT GAGAGAAAAC 60
ACCAGATTCA TTTCAGCTTG ACGATATCAC ACGACTAGAC TTGACTCGGG AGGAATGAAT 120
AAGTTTGTAG GAACTCGATA ATTATGTGAG AAAATTTGTC ACTTTGCAGT GATTAGCCAT 180
GGTTTTCCCA ATCTAACAGT AATAAATGAT CTTAATTTAT TGTAATCAAT AAGATTGAAA 240
GAAGCTTTTT GTAGGAAAAA GACAGAAAAA CAATAGACAA ACAGATAGAG GAAGACAGAT 300
AGAGACAAAA TATAGTCAGG CAGACAGCCA GAGACAGACA GATAGAGGCA GACTAAATTG 360
GCAGTGCATA ATGCACCTAA AAGTGGTTTG CAATCCACCA ATAAACAAGA GAAGAAAGAG 420
ACAAAAAGAC AGACAGATAC AGTATATAGA CAGACAGATA GAGACAAACA TACTGACAGG 480
TAGAAACAGA GAGAGATAAA GGCAAACAGA CTGATATATA GACAGATAGA AAGACAGACA 540
GATATATAGT CAGACAGACA GACAGAGGTA CGCAGAGACA AAAAAATAGA TAGATGGATG 600
GATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATGGA TGGATGGATG 660
GATGGATGGA TGGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA 720
GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA TAGTCATATA GTCAGACAGA 780
CAAAACAGAC AGACAGACAG ACAGAGACAA AAAATAGACA GATATACAGA CAGATATATA 840
GAGACAGACA GACAGACAAA GACAAACAGA GACAGAAAGA AAAATAGATA TAGTCAGACA 900
GACAAAAACA GACAGACAGA CAAACAGACA GAGACAAAAA ATAGACAGAT ATACAGACAG 960
ATATATAGAC AGACAGAAAT TTAGACAGAT TGATAGAGGC AGACAGAAAC AGAAAGACAG 1020
AGAGTCAGTC AGACAAAAAA AGACAGACAG AGACAATAAA TAGAGAGACA GACAAAAAGA 1080
TAGACACAGA TAGACAGACA CACAGACATA CAGTAAGACA GATTGATAGA GGCAGACAGA 1140
AACAGAAAGA CAGACAGACA AACAGACAGA CAGAGACAAA AAATAGATAT TTAGACAGAA 1200
AAAAAGACAG AATTCTTGCT GCTAATTTGA CTTCTTTATA TGTAAAAACT TTGAAACGTC 1260
ACATGTTTTT GACAGACTAC AATTTAAATG TTTCCCATCA GCACAACAAT GAGGGCTTAG 1320
TCAGCGGAGC ACTTTCCAGT AGACTGCATT GCAATAAAAC ATGGATAAAA CAGATCCTAG 1380
GCTTTTAAAA TCGTCATCCA GGGTCTCTCT CTCTCTCTTC GCTCTGGGAC AGGGAACTCA 1440
CACATAGTTT TATTATGTGG CTTCACCTTA AGGTTTCTCT TCAAACAATT CCAGCACAAG 1500
CTTAAGCAGT AATGAACTTC TGATGTCATC CGAAAAACCT CTAATGACTT TTCATGACAC 1560
TGATATCTAA CCACCAAA 1578