EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10740 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:20545984-20548164 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr3:20546846-20546863TTAAAATAAACAAAACA+6.15
HAND2MA1492.1chr3:20547973-20547983TGCAGGTGTT-6.02
IRF1MA0050.2chr3:20547601-20547622AAAAAGAAAAAGAAAATGAAG-6.17
IRF1MA0050.2chr3:20547641-20547662AAAACAAAAAAGAAAGTGATG-6.41
IRF1MA0050.2chr3:20546911-20546932TTGTACTTTTACTTTCAGTAC+6.62
ZNF143MA0088.2chr3:20547798-20547814TGTTGCATTGTGGGTA-7.54
Enhancer Sequence
TTTTTCTTTT TTCTTTTTAC AATAAAATCA AAATCAAGTG AATTAGTGCA ACAGGATTTA 60
GTTTGCTTGT TTAGTTTAGT TTCACGACTG CTTCCAGAAG ACATAACTCC TGTTTATTGT 120
GGTATTAACC AATCAAACTT CAAAACTACC AAAGTGTGAG TGTGTGTGAG TGAATAATGC 180
ATGTAAGAGA GAAACAGTGT GATTGTACCT GTGTGTGCGT CTGTGTGTGT GTAAGAGAGA 240
GAGAGAGAGA GAGAGAGTGT GTGTGTATGA GAGTGTAAAA GAGTGTAATT TCGTGTTTGT 300
GTGTGTGTGC GCCCATGTAT ATGTATAACA ACATCGGTAT TACACAGATG TTAGGAGGAG 360
ATGGTGAATT ATGTGGACAT TATGTATAAA ATTCAATCAC ACTAAATATT TATTATTTTC 420
AGAAAGTAAA ACTACACATA ATTTCCTGTA AGGGTTGGGT TTAGAGCATT CAAAAGTTTG 480
TAGAGTATAA AAACAATTGT AACCTATGTA ATGTCCCCAC AATTCACAAA AGTGTGTGTG 540
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG 600
AGAGAGAGAT AGAGTGAGAA CTGTGTGTGA GAGTGTATGA ATGTGTAAGA GAGTACATTT 660
AGGTGTGTGT GTGTGTGTGT AAAAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGTATGAAT GAACATGCTG 720
AATTATCTCA TCAGTGAAGT GATTTTCTGG TAAAAGAGCC TGACAATGTG AATTCTTGTA 780
CCATAGAAAT TATTTACAGA GAAAAACAGT ATCGTAAGCC ATGTTTCTTT TCATTCTGCT 840
TAATCAAGTG CCCCAAAGAT ATTTAAAATA AACAAAACAA TATGATGTCT TTTGACTGCC 900
TTCTTTAATA ACTACATTAC ACAATACTTG TACTTTTACT TTCAGTACTT GAGTAGTAAA 960
TTTTGAAATA AACTACTTGC AATACTTAAG TACAAAAAAT GTTGAATACT TTTGTACTTC 1020
CACTTAAGTA TGGTGCTTAA AGAGCACTTC TACTTCTACT CAAGTCACTT TTTGATAGAA 1080
CACTTGTACT TTTACTTAAG TATGGGTCTC TAGTACTTTA TACATCTCTG GTTGCTAGGT 1140
TACCAATACC ACAGTCAGCT GCTCTAACAA CTTGATGGAA ATTTATTTAG GATTTTATTT 1200
TTTTTGCAAA CTTAAAAAAA TAAATAAAAA AAACATTGTA TTGGCCAGCT ATTCATGAAC 1260
AAGTAGACAA ATTTAGGCCT TAGGAACCAA GAAGAAAGAG GAGAAAATGA AAAATGAGGC 1320
ACAGTATAGG TGACAGATAA GACGTCCAAG AAAGTGAAGC AGTAGGCAGT GGAAGAGAAG 1380
GCAATAAGGT AGCAAAGAAC ATCAAGAACA AGAATAAGAA GAAAAGAAAC TACAAGAGAA 1440
AGGCAAACAA GTACAGAACA AGTAAGAGTG GAAAATAAGG TGTTGACAGA AGGTGAAGCA 1500
GGCAAAGAGG TGGGCAAGGA AGAGGTTGGC AAAGAAGAAC AACAACAAAG AAGAAGAGAA 1560
ACTTTGAAAG TAAGAAAAAA ACAAGAACAA TGAGAGGTAA AGGAAAAAAC GGGAAGAAAA 1620
AAGAAAAAGA AAATGAAGGA ACAAAAAAGA AGGATGAAAA ACAAAAAAGA AAGTGATGCT 1680
GATTCAAGAC TGTCGGGAGA ACCATAGTAG AGGATTTCTC CTTAGTCACA CACAGAAGCC 1740
AGGACAAGAG AATGAGAAAG GAAGTAGGGA AGAGCAGAAA AAGAAGAAGA GATGAATAGA 1800
TTCCTTTGTG CTTTTGTTGC ATTGTGGGTA TGCGTGACAA GCGCACTCTA TCAAGTGTGA 1860
CATCCTCTCT TCCTAAACGT TACACTTGTT CTAGTGAAGC ATTTTTCCTC TTTTCTGTGT 1920
CGGTCGAGCG CAGCTGGGGG CTCAAGTCAT TGCCGGTTAA TCTGCCGCTG CTGTTTGTTT 1980
GTATGTGCGT GCAGGTGTTT TAACATGGTG TGAAATGGCT GTGTGTTCAC AGCTCGACTT 2040
TGACAATCAT ACAGATACAT GGAGAAGGGC AACCAAAGAC ATGTCTATCA AAATGTAGAG 2100
GATACACAAA ATAAAGAAAT AGAGGGGAAA TTAAAGTATA TAATACAATT CACTGAAGTA 2160
TGGGTCTAAG TTATTCCACT 2180