EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10712 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:16702065-16704406 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr3:16702852-16702866TTTGTTTATGTTTG-6.38
Foxd3MA0041.1chr3:16702861-16702873GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:16702865-16702877GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:16702869-16702881GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:16702873-16702885GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:16702877-16702889GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:16703318-16703330GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:16703592-16703604GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:16703588-16703600GATTGTTTGTTT+6.92
Foxj3MA0851.1chr3:16702849-16702866TTGTTTGTTTATGTTTG-6.05
Hmx3MA0898.1chr3:16703274-16703291ATTATTTAATTGTGTGT-6.1
NR2F1MA0017.2chr3:16702227-16702240CAGAGGTCACCGG+6.11
ONECUT3MA0757.1chr3:16702656-16702670TGTATTGATTTTAT-6.11
POU4F1MA0790.1chr3:16703269-16703283CATTAATTATTTAA-6.47
POU4F3MA0791.1chr3:16703267-16703283TGCATTAATTATTTAA-6.32
RREB1MA0073.1chr3:16703989-16704009TGTGTGTGTGTGTTTGGTGT-6.41
ZNF263MA0528.1chr3:16702605-16702626TGAGGAGGAGGAAGCAGGAAA+6.21
Enhancer Sequence
GCATGACTTG GCCTTTTCAT CAGGTCTTTG GAAACGTCCA ACTGGAAGCT CGCTCATCCG 60
CAGTCTTTTA TTGTCCACCT GTGTTTCTTG CGTGTTGGTG TCAAACCTGT GAGTAGGGCG 120
TTAATGGAGA CGCAGATTGG AGGAGACGCG CAGTGTTCAG AGCAGAGGTC ACCGGGGGGG 180
CTGTATTTTG TTGTAAGTGT CATGTTCGGT CATTAGCAGA ACGAGACGGA GGCAGGACGG 240
GACACCATTG AGTCTGAATG GAGGATGCTG GGCGAGTGGG TGGTCTGTGT GTTGGGCCAC 300
ACACACACAC ACACACACAC ACGCGCACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 360
ACACACACAC ACACTCTCTC TCTCTCTCTG CTGTCTCTTT ATGAGGAGGT GTGGTGATGG 420
GCCGTTTGTC CCTCTCGCTG TGGGACAGCA GAATGTTCAC ACTGACAGGC TGCTCTTTGT 480
GTGTGCGGCG CAGTGTGTGT GTGTGTGTTT GACTGATCGA TGAGGCGCTG AGAGGACAGA 540
TGAGGAGGAG GAAGCAGGAA ATCACTGAGT GTGTGATTTG AGTTTTGTGT GTGTATTGAT 600
TTTATGTGCT TGTGCATGTG TGTTTCTGTT GTGTGTGTGT GTGTGTGAGA GAGAGAGCAT 660
CTGGGGTCTG ATTCTGTGCT TGGGTGTGTG TGGATTGATT TTGTGTGAGA TTAGGATTGT 720
GTGCATGGCT GGTGTTTGTA AGATTCTGAT TGTGTTTGTG TGTTTTAGGA ATTGTTCATT 780
AATTTTGTTT GTTTATGTTT GTTTGTTTGT TTGTTTGTTT GTTTGTGTGT GTGTGTGTGT 840
GTGCCCGCGC TTGTGTGCAT TAATTGTGTG TTAGATGGGG ATTGTGTGCA GCATTTGCGT 900
GTTTGTTGTT TGCAAAGAAT TGTGAGCATT AATCATGTTT GTTTGTGTGT GTGTGTGAGC 960
ATGTGGTGTG TTTGTGCTTA TCCATATGTG TTTGTGCATG GGGTGTGTGT GGACTGTTGC 1020
ATGTGCTTTT GTGTGCATGG TGTGTGTGTG TGAGACTATT CAAGTTGTAT GGATTTTATT 1080
GTGTGTATGT ATGTGTGTGC ACGTGTTTGT TGTTTGTCGG TGTGTGTGTA TGTGCTTGTA 1140
ATTATGTTCA TTAATTTTGT TTGGTGTGTG TGCGTTTGTT TGTCTGTGCG CTTGGTATTG 1200
TGTGCATTAA TTATTTAATT GTGTGTGTGC GCGCCCATGT GGTGTGTGTG CGTGTTTGTT 1260
TGTTTGTATG CATGGTTGGT ATTTGTAAAA TTCAAAGTGT GTGTGTATGC ACTTGGGATT 1320
GTGTTAATTA TTTTAAATTT GGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1380
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGCGCG CCACTTGGGA TTGTGTGCGC 1440
ACTTGTGCGT GTGTTTGTGT GCATGCTTGT GCATGTGTTT GTATACATGG TGTATGTATG 1500
TAATTGGGAT TGAGGGTATG TTTGATTGTT TGTTTGTTTG TATGCATGGT TGGTGTTTGT 1560
GTTCAGATTG TGTGTAAGGT TGGGATTGTG TGCATTAATT GTATTTTTGT TTGATTGTGT 1620
ATGTGTGTGC ATGCACGTGG TGTGAATGCA TTTGTGTTTT GTTGTTTGTA TATGCATGTG 1680
TGTGTGCTTG GGATTGTGTG ATTTTAATTT TATTTGTTAT AATGATATTA CATTATTTAC 1740
ACGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGC GTGCGGCCAT GTGGTTTGTG 1800
CGTGTGTTTG TATAAATGTT GTATATTTGC GTGGGATTGT GAGCATTAAT CATGTTTGTG 1860
TGTGTGTGTG AGCATGTAGT GTGTTTGTGC TTGTCCATAT GCATTTGTGG ATGGTGTGTG 1920
TGTGTGTGTG TGTGTGTTTG GTGTGTGAGA GATTGTGTAG AATTGGAATT TTGTGTTTGT 1980
AATGTTTGTA TGTGTATTGT ACTTGTGCAT GTAGATTTTT GTGATGGCTC ATGATTGTGT 2040
ATTTGTGTGT GTTTCTGGTG TGTTTGTGTG TGTGTCATTG TATGAGAGGG AGAGAGCGAG 2100
CCTCAAACGG TCCCTAACCG TCAGTCTTAT CATATGAGTG TCAGACTCTC ATTAAAAGTG 2160
AAACCGAGAG GGAGGGAAGA TCAAGTGTGA AACTGACGGT TTAAGAAAGC AAGGATATTC 2220
TTCTTCATCA TCATCATCAT CAGCCCAATG CAGAAGTCAA TCCTTTCTGT GCATAAGGAA 2280
AACAATCATT GCAATTATTC AGTTAATGTT TGTAGATCAC ATGTCCCGTT CCAAACCCAT 2340
A 2341