EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10680 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:14327778-14329424 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:14328056-14328074GGATGGATGGATGGAAGG+6.49
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:14328064-14328082GGATGGAAGGATGGATGG+6.57
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:14328068-14328086GGAAGGATGGATGGATGG+6.59
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:14328060-14328078GGATGGATGGAAGGATGG+6.6
HNF4A(var.2)MA1494.1chr3:14329220-14329235GTGACCTTTGACCTC-6.04
HNF4GMA0484.1chr3:14329221-14329236TGACCTTTGACCTCC-6.53
NR2C2MA0504.1chr3:14329221-14329236TGACCTTTGACCTCC-7.95
Nr2f6MA0677.1chr3:14329221-14329235TGACCTTTGACCTC-8.42
RXRBMA0855.1chr3:14329221-14329235TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRGMA0856.1chr3:14329221-14329235TGACCTTTGACCTC-8.12
RxraMA0512.2chr3:14329221-14329235TGACCTTTGACCTC-8.12
Stat6MA0520.1chr3:14329308-14329323AACTTCCAGAGAACT+6.23
Enhancer Sequence
GATATTAGAT AGATCAAAGT CAAAGTCAGC TTTATTGTTG ATTCAGCCAC ATGTACAGGA 60
CATATAGAAA ATCGAAATTC AAAACCCTTG GTGCCTAACA TATAATATTA AAATAAAAAA 120
TAATGTGTGT GTGTGTGTGT GCGTGCATGC GTGCGTGCGT GCGTGTGTGT TTCTATCCAA 180
TATCTATCTA ATACTGTTTT ATTTTAAGAA TTCCTTCTGT CTGGTAAATT CTATATCTAT 240
ATTATATAGA TTTTGGATGG ATGGATGGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT GGAAGGATGG 300
ATGGATGGAT GATAGATATA AAATAGCTAT TGGATGGGTG GATAGATCAA TATTAGATAG 360
ACATTGGATG GATGGACTGA TGGATGGATA TTAGAAGGAT CAATGATGTA CCGATGGATA 420
GATTGATATT GGATGGATAT TAGATAGATG TATGTATGGA TGGATGGATG GATGGATGGA 480
TGGATGGATA GATCGATATT CATTAGATAT TGGATAAATG GATGGATGGA TGGATATTAG 540
AAGGATGGAT GGATGGATGG ATAGATGGAT GGATATATGG ATGAATAGAT TGATATTAGA 600
TGGATTGATG AATGGATAAA TGGATGGATA GATCGATATT AAATAGATAT TGGATGGATG 660
ATAGATGGAT GAATATTAAA TTGATGGATA AATGGATGGA TGGATAGATA TATATTGGAT 720
GGATGGATGG ATATATCTAT ATTAGATAGA TATTGAATGG AATGATATTG GATGGATGGA 780
TTGAATGATA TAAGATAGCT ATTGGATGGG TGGATAGATC AATATTAGAT AGACATTGGA 840
TGGATGGACT GATGGATGGA TATTAGAAGG ATGAATGATG TACCGATGGA TAGATTGATA 900
TTGGATGGAT ATTAGATAGA TGTATGGATG TATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATAGA 960
TCGATATTCA TTAGATATTG GATAAATGGA TGGATGGATG GATATTAGAA GGATGGATGG 1020
ATGGATGGAT GGATATATGG ATGAAAAGAT TGATATTAGA TGGATTGATG AATGGATGGA 1080
TAGATCGATA TTAAATAGAT ATTGGATGAA TAGAACAATA TTTGATGGAT GGATGGATAT 1140
TGGATAGATC AATATTAAAA AGATAGTGGA TGGACATGGA TGAATGGATG GAGAGATATT 1200
AGATAGATAT TGGATGGATA GATGGATGGA TCAATATCAG ATACTAGATG TATGGATGGA 1260
TAATAGACAG ATACAGTAGA TGGATGAATG GATGTCTCAT GTAATCTCAT TTTTTACTAT 1320
GGTATTTTAA ATCACCCAGC CATGTGATAA ACAAATTAAT AAGTGCATAT GTGTGATCAT 1380
TGTTTAAAAA CAAATCTCTG TGAAATTTGC TGTACTGTAA GCTGGATGTC CGTAGTGATG 1440
CTGTGACCTT TGACCTCCAG CTGGCCCACA AGTATGACCC ACAAAAGGAG GAGGAGCTGA 1500
GGATGTGGAT CAGTGATGTC ACAGGCCGCA AACTTCCAGA GAACTTCATG GAGGGCCTGA 1560
AAGATGGAGT CCTGCTGTGC GAGTGAGTGA TTCATGAAAC TACATCTGAA GAGCTCAAGA 1620
GACGGTTTGC CAAGCTAACT CTGTAA 1646