EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10669 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:12956216-12957439 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PRDM1MA0508.2chr3:12956856-12956866GTGAAAGTGA-6.02
RREB1MA0073.1chr3:12956617-12956637CACCAACACACACACACACA+6.14
ZNF384MA1125.1chr3:12956230-12956242TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr3:12956231-12956243TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr3:12956232-12956244TTTTTTTTTTAA-6.44
ZNF384MA1125.1chr3:12956233-12956245TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
TATTATTATT ATTATTTTTT TTTTTTAAAT TATTATATGT ATATATTCTT TTTTTTACTA 60
GCACAGTTTA CTGTGTTTTT ATTAAATATG TATGTTCTTT TATTTTATGT AAACTTTAGA 120
ACTGTTTTGG CAATAAAGCA ATTATTGAAT TGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGGGGGGG 180
CTGACCTCAT TAGCAGAAAC TCTCTTTGTG ATGCCATGAA GCTATTCTAA ATATTGACCA 240
CACACAGACT CACACTTTAC AACACACACA CAAACATGCA CACACACAAC ACACACAAAA 300
TAAAACTGAC ACTGAGAAAT TGCATGGGGA GAAAGAGGAG AGAAACCTGC AGCTGGACAC 360
AACTTTCACT GAATACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACCAACAC ACACACACAC 420
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACTCCTGCTG TACAGCTGCC CAGACAAACA 480
TCCTCAGGCC AAGTCAGTTA AGGCTATTCA TTAGCCAGCC ATTTTTCCTA CTGTTCTAGT 540
TTGTGTGTTT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 600
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTTT GTGAAAGTGA GTGTATGCGC 660
ATGTGTCTGC GTGTGTTTGT AGATGTGTGT GGATATGAAT TTGTGCATGT GAGTGTATGT 720
GTGTGAGTGT GTACGCATGA GAGCGATCAC AACACTGGCC AGAGCAAACA CACCTGTGTG 780
GAAGCTGTCA AGAGTCTCTG AATCACAGGC AAACATCAGA GCTTCCTCCA GCAGCAGCAA 840
CAGAGCATGT AGAGTAGCAG GAAAACAGCG ATACTCATGT GCGCGCGCAC ACACACACAC 900
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 960
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 1020
ACACACACAC ACACACACAC CAGCAGCTTA GCTCAGTCTC TGCATGATCA TCCACAGTGC 1080
TGGACACCAG CTGGAGAAGC AGCGACTCTC ACAGGACACA TGCTGCAACT GCAGGCCTAA 1140
TGTTCAAGTG CACCTTTTAA ACTGGTAGCA GAATGAAGTA CTGTCATTTC ACAATTATTT 1200
ATCACACACT TCCATCAGCA GAT 1223