EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10658 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:12030303-12032617 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr3:12031624-12031638CAAACATAAACAAA+6.38
IKZF1MA1508.1chr3:12032358-12032370AAAACAGGAAGC+6.62
RREB1MA0073.1chr3:12031660-12031680CACCCACCCACACACACACA+6.06
ZSCAN4MA1155.1chr3:12031931-12031946CGCACACACTGAAAG+7.66
Enhancer Sequence
ACACACAATC AAACACATAG AATGAGAGAG ACAAACACAC TCACACACAC ACACACACAC 60
ACACGTGTTG TTGTTTGTTT GTGTATTACT GTGTCGCTCT CTCACACACA CTCACACACA 120
CACACAGAGA GCAAGTGACA AACACATATA CAGTGTGTGC GTGTGTGCGA GTAAGTGAGA 180
AAGAGACACA AACAAACAAC AACACACGGA GACAAACACA GAGAGTAAGT GGCAAACACA 240
CAGACAAACA AACAAATAAA CACACACACA CACACACACA AAGACTGAGG CAAACAACCA 300
AAATCCCAGT GTCAAACCCA CCAAAAACAT AAGAGACAGA GTAACAAACA CACAGAGTGA 360
GAGCGACAAA CACAGACAAA CAACACACAA ACACAAAGAA AGAGAGTGAG TGAGTTACTG 420
ACAAGCAAAC ACACACACAC ACACATTGAA AAAGACACAC ACAGAGTAAG TGACAAACAA 480
AACACACAAA CACACACACA CACAGAGTGA ATGACAAACA CACACACAAA CTAACACAGA 540
GAGAGACAAA CACAAACAAA AACAAACAAA ACACGGACAA AGCATGAGAA ACACAAAGAG 600
TGAGTGGCAA ACACAAACAC ACACAAACAA AACACAAACA CACACACACA CAGAGTGAAT 660
GACAAACACA CACAAACAAA CACAGAGTGA GAGAGACAAA CACAAACAAA AACAAACAAA 720
ATGACTGACG AGCAAACACA CACACACACA AATGCAGTGA AAGAGACAAA CACAAACAAA 780
CAGAAAGACT AACAAACACA CATACACAGA GTGAGAGAGA GACAAACACA AACAAAACAA 840
ACAAAATGAC TGACAAGCAA ACACACACAC ACAAACGCAG AGTGAGAGAC AAACACAAAC 900
AAACAGAATG ACTGACAAGC AAGCAAACAC ACGCAAAAGC AGAGAGACAA ACACAAACAA 960
AAACAAACAA AATGGCTGAC AAACACACAC AGACACACAC ACAAACGCAG AGACAAACAA 1020
AAACAAACAG AATGGCTGAC AAACAAACAC ACACACAGAG TGAGATAAAC ACAAACAAAA 1080
ACAAACAGAA TGACTGACAA GCAAGCAAAC ACACACAAAC GCAGAGAGAC AAACACAAAC 1140
ACAAACAAAC AGAATGACTG ACAAGCAAGC AAACACACGC AAACGCAGAG AGACAAACAC 1200
AAACAAAAAC AAACAAAATG GCTGACAAAC ACACACAGAC ACACACACAA ACGCAGAGAC 1260
AAACAAAAAC AAACAGAATG GCTGACAAAC ACACACAGAC ACACACACAA ACGCAGAGAG 1320
ACAAACATAA ACAAACAGAA TGAGTGACAA ACAAACACAC CCACCCACAC ACACACACAC 1380
ACACACACAC ACACACACAC ACACACAGAG AGTGAGACAA ACACAAACAA AAACAAACAG 1440
AAGGACTGAC AAGCAAGCAA ACATACACAC ACACAAACAA ACAGAATGAG TGGCAAACAA 1500
ACACACACAC AAACACAGAC AGACGCACAA AACACACAGA GAGTGACAAA CACACGAGAG 1560
ATAGAGTGAC TGACAAGCAC ACAAATACAA ACACAAGTAA CGTTACACAC AGCGAGTGTC 1620
TATTCCCCCG CACACACTGA AAGGCGCTTC AAACAGCGGT TGTTGTGTTT TTGTGTTTGC 1680
GAGATGAACG AAGACAAAAG AGCAGTCATG GCGAGCTTTC TGGTGTTTAC CACTGAAAAT 1740
ACCGTATAGT CGCACTGTCC TGAGATCAGC ATCCGCTTCA AACACACAGA CAGCTTCAAA 1800
AGCATCGACA TAATCAACTG CCATTATCCC ACATTATCCT ACTATCATTA AAAGTTGCAC 1860
TCTTTGTGTA CGTATGCCAC ACTTCCGAAC AGAAGCAGTA CTTACAGTCC AGCTCTTCGG 1920
GAAATCCTGA TTAAAACAGA GATTTTAATG ATCTGCTGAA GCTGTATGAG TTATGATGGA 1980
CAGGGAAGAG ATTGTAGAAG TGGTCAATAT TACGGGAACT CGCTTTTGTC TGCGGAGCTC 2040
GAGCTCTCCG AACTCAAAAC AGGAAGCGGC AGGAAGAAAC CACGTGGCCT TCAGAGGCCG 2100
CTCTTAAAGG GACAGTTCAC CCAAAATTCA TGACAGCTTT AGATATAGGG CACTTTCAAC 2160
AATTTTAGAG GACACAGGAT TGGGTCATAG GATTTAGTAG GGTTTTGATG ATTATGTCCA 2220
TTTAAGAGTT GAGGAGCTCA GTACGGAAGA TGGAGGAGCT GAACACGCAG TGCCAGCTTT 2280
GGTATGAGAA CTGATGGATC CCAGGCACCC CCAC 2314