EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10612 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:6878534-6881028 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MIXL1MA0662.1chr3:6880396-6880406TCTAATTAAC+6.02
PBX1MA0070.1chr3:6878628-6878640TATGATTGATGG-6.37
PBX1MA0070.1chr3:6878731-6878743TATGATTGATGG-6.37
PBX1MA0070.1chr3:6878830-6878842TATGATTGATGG-6.37
PBX1MA0070.1chr3:6878909-6878921TATGATTGATGG-6.37
PBX1MA0070.1chr3:6878968-6878980TATGATTGATGG-6.37
PBX1MA0070.1chr3:6879055-6879067TATGATTGATGG-6.37
PBX1MA0070.1chr3:6879192-6879204TATGATTGATGG-6.37
PBX1MA0070.1chr3:6879333-6879345TATGATTGATGG-6.37
PBX1MA0070.1chr3:6879539-6879551TATGATTGATGG-6.37
PBX1MA0070.1chr3:6879634-6879646TATGATTGATGG-6.37
PBX1MA0070.1chr3:6879827-6879839TATGATTGATGG-6.37
PBX1MA0070.1chr3:6879938-6879950TATGATTGATGG-6.37
PBX1MA0070.1chr3:6880411-6880423ACATCAATCAAT+6.44
ZNF24MA1124.1chr3:6879486-6879499GAATGGATGAATG-6.19
Enhancer Sequence
CCGTTGAACT GGGTGTGTTG GTTCCATATC CAGAAGATGG AAGAGACGCC AGGGACCAGC 60
GACGCCCATC TCTGCACAGA TGGATGGATG GAGATATGAT TGATGGATAG ATGAATTGAT 120
GGATGGATAG AGAGATAGAT GGATAGATGA ATGTATGAAT GGATGGATGG ATGGATGGAT 180
GGATGGATGG ATGGAGATAT GATTGATGGA TAGATGAATT AGTGGATGGA TAGAGAGATA 240
GATGGATAGA TGAATGTATG AATGGATTGA TGGATGGATG GATGGATGGA TGGAGATATG 300
ATTGATGGAT AGATGAATTG ATGGATGGAC AGAGAGATAG ATGGATAGAT GAATGTATGA 360
ATGGATGGAT GGATATATGA TTGATGGATA GATAAATGTA TGAATGGATG GATGGATGGA 420
TGGATGGATG GAGATATGAT TGATGGATAG ATGAATTGAT GGATGGATAG AGAGATAGAT 480
GGATAGATGA ATGTATGAAT GGATGGATTG ATGGATGGAG ATATGATTGA TGGATAGATG 540
AATTGATGGA TGGATAGAGA GATAGATGGA TAGATGAATG TATGAATGGA TGGATGGATG 600
GATGGATGGA TAGATAAATG GATAAATATA GAGAGATGGA TGGATGGATG GATGGAGATA 660
TGATTGATGG ATAGATGAAT TGATGGATGG ATAGAGAGAT AGATGGATAG ATGAATGTAT 720
GAATGGATGG ATGGATGGAT GGATAGATAA ATGGATAAAT ATAGAGAGAT GGATGGATGG 780
ATGGATGGAT GGATGGAGAT ATGATTGATG GATAGATGAA TTGATGGATG GATAGAGAGA 840
TAGATGGATA GATGAATGTA TGAATGTATG AATGGATGGA TGGATGGATG GATGGATGGA 900
TGGAGATATG ATGGATGGAT AGATGAATTA GTGGATGGAT AGAGAGATAG ATGAATGGAT 960
GAATGTATGA ATGGATTGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT GGAGATATGA TTGATGGATA 1020
GATGAATTGA TGGATGGATA GAGAGATAGA TGGATAGATG AATGTATGAA TGGATGGATG 1080
GATGGATGGA TGGATGGAGA TATGATTGAT GGATAGATGA ATTGATGGAT GGATAGAGAG 1140
ATAGATGGAT AGATGAATGT ATGAATGGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT GGATGGATGG 1200
ATGGATGGAT GGATGGATGG ATGGATGGAT GGATGGATGG ATGGATAGAT AAATGGATAA 1260
ATATAGAGAG ATGGATGGAT GGATGGATGG AGATATGATT GATGGATAGA TGAATTGATG 1320
GATGGATAGA GAGATAGATG GATAGATGAA TGTATGAATG GATGGATGGA TGGATGGATG 1380
GATGGATGGA TGGATGGATG GAGATATGAT TGATGGATAG ATGAATTGAT GGATGGATAG 1440
AGAGATAGAT GGATAGATGA ATGTATGAAT GGATGGATGG ATGGATAGAT AAATGGATAA 1500
ATATAGAGAG ATGGATGGAT GGATGGATGG ATGGATGGAG ATAAGGACGG ATGAATAGAG 1560
AGTGGATAAA TGAATGGATG GATGAATAGA GAGATGGATG GATAAATGGA TGGATGAATA 1620
GAGAGATGGA TGGATGGAAA GAATTAAAAT GCTTGAACAC TCAGTTAAAG CTGTGTGTGT 1680
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1740
GTGTGTTTTT ATTTACCGTC TAGAGGAAGC GAAGGAGAAA TGTGCAGGAG TACTGGGAGA 1800
GAAGTTACGA GGGCTGTCCA GAGGACTACT TCCTGTAGGG ACAGCAACAA ACACAAACGC 1860
AATCTAATTA ACAACAAACA TCAATCAATC AACAACATCA GGACTTTTTT CAATAGTCTA 1920
CAGAACAAAC CATCGTTACA TAATAACCTG CCTAATTACC CTAACCTGCG TAGTTAACTT 1980
AATTAACCTA GTTAAGCTGT ATAGAAGTGT CTTGAAAAAA AATCTAGTCT AATATTAATG 2040
ACTGTCATTA TGGCAAAGAT AAAATACATC AGTGATTAGA GATGAGTTAT TAAAACTACT 2100
ATGATTAGAA ACGTGTTGAA AAAATCTGCT CTCCGTTAAA CAGAAATTAG GAAAAAAAAT 2160
AAACCGGGGG GCGAATAATT CTGACTTCAA CTGTACATAA TCATTGAAGA AATGACAAAA 2220
AGAAGGAAAG GGAGAGAAAG TTAAAAGCTT TTGCATACAC ACCAATAAAC CAGTCTGTAA 2280
AGATTGATGA TTGGCTATTT TGACTGGAAG GCGGGACTTC CTTTGCTAGG GTGGCCATAA 2340
TTAGCCTTGC CCTTTTCCTC ATTCATACTA ATGCAAACAG ACTGCCTTTG TACATCTGTC 2400
GCCTTCGCTA AAACCCATCC AGACTGCCTT AAAGAGACAG TACACCCAAA ATAAAGAAAA 2460
TTCTGCCATC ATTTAAACAT CCTCCCCTTG TTCA 2494