EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10600 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:5860180-5861234 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr3:5860223-5860235AAACATATGCTG+6.04
RREB1MA0073.1chr3:5860767-5860787ACACACACCACACACACACA+6.16
RREB1MA0073.1chr3:5860816-5860836ACACACACCACACACACACA+6.16
RREB1MA0073.1chr3:5860716-5860736ACACAACACACACACACACA+6.19
Enhancer Sequence
TTTCCCAGTG CTAGGTTGTG GCTGGAAAGG CATCCGCTGT GTAAAACATA TGCTGGAATA 60
GTTGGTGGCT CATTCCGCTG TAGCAATCTC TGATAAATAT GGGACTAAGC TGAAGGAAAG 120
TGAATGAATA TAAATTCAGC TTCACACTTC TTTTATTTAG ACATGCAGTT CTTAATTTTT 180
GCACAGNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 240
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNACAC ACACACACAC 300
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 360
ACACACACAC ACACACACAG ACACACAGAC ACAAAAATCA TACAGACACA TAAACAAACA 420
CACACTCAGA TGTTACACAA TAACACACAC ACACACACAC ACACACATAT ACGTAAACGC 480
AAACGCACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 540
AACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACCACAC 600
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACCACACA CACACACACA 660
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACATATA 720
TACTCATACA TACACATATA TACATTCATA CATACATATA TATATATTCA TATATATATA 780
TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA 840
TATATATATA TATATATACA CACACACTCA CTCTCTCTCT CTCTCTCTTT CTCTCTCACT 900
CATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA 960
TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA 1020
TATATATATA CATACAGTTG AAGTCAGAAC TATT 1054