EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10597 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:5749717-5751045 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr3:5749948-5749959ATATTAATTAT+6.02
Klf1MA0493.1chr3:5750243-5750254AGCCACACCCT+6.02
Klf1MA0493.1chr3:5750748-5750759AGCCACACCCT+6.02
Klf1MA0493.1chr3:5750880-5750891AGCCACACCCT+6.02
MecomMA0029.1chr3:5749860-5749874AGTTATCTTATCTA-6.32
RREB1MA0073.1chr3:5749797-5749817CCCCACCCCAACCCTAAACC+6.06
TFAP4MA0691.1chr3:5750498-5750508AACAGCTGAT+6.02
Enhancer Sequence
ACGTTTGCGG CCGGAAGTTA ACCAGAAATA TTTCTATTAT TTATTAAATT TCATATTTGT 60
TGTATTTTAA TAACGTCTAC CCCCACCCCA ACCCTAAACC CAACCGTCAC AGTAATGTAA 120
AAACAGTTGT TGTACCGAAT ATTAGTTATC TTATCTATTA AATTACCCAA TAAAATGTAT 180
TTTTTAACGC CTACCCCCAA CCCTAAACCC AACCATCACA ATACTGTAAA AATATTAATT 240
ATTGTTATAC AGTGTCATAA AAAAATGCTG CTTTATTAAT GTGCATATCA CACTTCCGGC 300
CGGCCGCATA TCCGATCTAG ACTTTACCCT GATTAGCTGA GTGGGAGATT GGGGCAAATG 360
GACGAAAGCA GGCCAGAAAT GAGACATACA CTGATAGCTC CACCCTAAAT GACTAATACT 420
GCTGCCCTAA CTGACTAAAA GCCTCATCAT AAATGACTGA TAACTCCACC CACAGGACTG 480
ATAGCCCCAA CCTAAAAAAG TGATGGCTCA GCTCTAAATG ATTGATAGCC ACACCCTAAA 540
TGACTGACAG CCCCGACCTA AACAACTGAT TACCCTGCCC TAAAGGACTT ATAGCCCCAC 600
CCTAAATGAC TGATAGATCC ACCCTAAAGG ACTGATAGAT CCACCCTAAA GGACTGATAG 660
TCCTGCCCTG AAGGACTGAC AGCCCTGACC TATACGACTG ATAGCCCCCG CCCTAAATGA 720
CTGACAGCCG CAATTTAAAC AATTGATAGC CCCGCCCTAA AGCAATGACA GCCCTGACGT 780
AAACAGCTGA TAGCCCTGCC CTAAAGGACT GATAAACACG CCCTAAACGA CTGATTGCCC 840
CACCCTTAAG GACTAGCAGC CCCTAACTAA ACAACTGATA GCCCCGCCCT AAAGGATTGA 900
AAGTTACAAC CTAATTGACT GATAGCTCCA CCCTAAAGGA CTGACAGCCT CGCCCTAAAG 960
AATTGACAGC CCCAACTTAA ACATCTCATA GCCCCAGCCT AAAGATGAAT AGATCCGCCT 1020
TAAGGATTGA TAGCCACACC CTAAAGGACT GACAGTCTCG ACCTAAACGA CTGATAGGCC 1080
CACCCTAAAG AACTGATAAA TCCGCCCTAA AGGACTGATA GCCCTGCCCT AAAAGACTAA 1140
CAGCCCTGAC CAATATGACT GATAGCCACA CCCTAAAGGA CTGATAGCCC CACCCTAAAT 1200
GACTGATAGC CCCACCCTAA AGGAATAATA GCCATGCTTT AAAGGTCTGA TAGCATCACC 1260
CTAAAGGACT CACAGTCCTG CCCTAAAAGT CTGACAGCCC CAACCTAAAC AACTGATAGC 1320
CCCACCCT 1328