EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10596 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:5538641-5539957 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr3:5539860-5539879TGGCCACTAGAGGGAGCAC+6.69
Hmx2MA0897.1chr3:5539517-5539534GTAAGCAATTAAAACAT+7.05
Hmx3MA0898.1chr3:5539517-5539534GTAAGCAATTAAAACAT+6.79
ZNF384MA1125.1chr3:5539440-5539452TCAAAAAAAAAA+6.11
ZNF384MA1125.1chr3:5539442-5539454AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr3:5539443-5539455AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACAAT AACACATTTT ATAATGCATT 60
CTCATTATTC AATGAAGTAA AGCACTTTCA GGACTTGTAT CTTATTTATT TTCGGGAGTT 120
TTATAATCAC ACATACTTTA TTGTGTTTTA GTATTAATGA TGCAATGGTG AAAATGTATG 180
TCTGTCAGTC TATCTATCTA TCTGTCCGTC CGTCCGTCCA TCCGTCCGTC CGTCCGTCCA 240
TCGATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 300
TCTATCTATC TATCTATCTA TATGTCTGTC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 360
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTACC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 420
TCTATCTATC TATCTATCTA TCCATCCATC CATCCATCCA TCCAACCATC CATCCAACCA 480
TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC TATCTATCTA 540
TCTATCTATC TATATGTCTG TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 600
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCCATC CATCCAACCG 660
TCCGTCCGTC CGTCCGTCCG TCCGTCCGTC CGTCCGTCCG TCCATCCATC CATCCATCCA 720
TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 780
TCTATCTAGG CTGTCTGATT CAAAAAAAAA AAAATGCAAG TCATCGCCGG CTCGGAGAAC 840
AACACTTTAC AAAAAGACTA CATCGCAAAC TGATCTGTAA GCAATTAAAA CATAATTCTT 900
TAACCAAAAA AAAAAATAAA AATTTAAATA AACTAGAACT ACAACAGAAC TTGACAAAAG 960
ACTGCAATGT AAATACTCAA AATACCAGCA CACATTACAA CCATGTCCTA TGAAATAGTT 1020
TACAACTTTT TTAATAAACC TACTACTACA CTATTTCTAA ATGCATATTA AAAGTATCTC 1080
AAACAAGTAA GGAAAGGAAC TCACTTTTCT CAAATGGACG CTCACAGCTC TTGATAATCA 1140
GCTTCAGCTC TGCGTTATGA CTACTTTATG AAGCGCAGCT GTTTCTGTCA TGCGCAGTTC 1200
ACCTCTTCAT GTTCGCTTAT GGCCACTAGA GGGAGCACAA GCGCTGTAAA AATTACTGAT 1260
GCAGATTGTA ATACTTTACA GAGACAAGAG TCAATTCAGC TTCAGCATTT ACTTAA 1316