EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10587 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:4139547-4140943 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA10MA0899.1chr3:4140841-4140852TTTTTATTACT-6.14
HOXA13MA0650.2chr3:4140717-4140728ACCAATAAAAC+6.32
HOXB13MA0901.2chr3:4140717-4140728ACCAATAAAAC+6.32
MEF2CMA0497.1chr3:4140883-4140898ATCTATTTTTGTATT-6.11
NFYAMA0060.3chr3:4139753-4139764TCTGATTGGCC-6.02
POU4F1MA0790.1chr3:4140901-4140915ATGAATAATTAATG+8.42
POU4F2MA0683.1chr3:4140901-4140917ATGAATAATTAATGTT+6.69
POU4F3MA0791.1chr3:4140901-4140917ATGAATAATTAATGTT+7.38
TFAP4MA0691.1chr3:4139830-4139840AACAGCTGAT+6.02
Enhancer Sequence
TGAGTAGGCC CTTAATCTAG GGCTCTTAAA CTTAGGACTC TAAACACACA CACACACACA 60
CACACACACA CACACACACA AAGGCCAGTT CCTCTGACGT CTGCAGTCGA TGTAACTGTG 120
CTTCAGCATT TCACACACAC GTTTTCATTT CTCTCTCTGT TGAATGGGAG GGGGAGGGGC 180
CTGGGGGCGT GAGGCAAACG GAGTGCTCTG ATTGGCCGTT GCTGCAGCAG CTCTTGACTC 240
TTTGCAGGAA TGTTCCGGGT CAGACACACT GATGACTCAT TATAACAGCT GATCTCTGAA 300
CAGCAGACTT TCACAATCAC CCTGAGGACA AACTCACACA CACACACACG CAGCGCACGT 360
CTCTCAACAC ATACACACAC ACACAATGGG ATGTGTTATT AATGAGAGGT TTCTCCTGTA 420
CATCATCAGC ATACTTCACT CTGAGCTGCT TTCATCATGA AAACACACAC ACACACACAC 480
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACAGAA 540
AGAGACTCGC ACACAATTGC ACATATACAT AGACACACAC ACACACACAG AGAGAAAGAG 600
ACTCGCACAC AATTGCACAT ACACACACAC ACACACACTG AGTTGTGTTA TTAATGAAAG 660
GTTTCTGCTG TACATCATCA GCATACTTCA CTCTGAGCTG CTTTCATCAT GAAAAACACA 720
CACACTCACA CACACACACA TACACACAGA GAAAGAGACT CGCACACAAT TGCACATAGA 780
CACACACACA CATACACACA CACAGAGAAA GAGACACTCA AACAATTGCA CATAGACACA 840
CACACACACA GACACAAACA CTCATACAAG CAGACACACA CACACACACA CACACACACA 900
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CAGGTCATCA CAGTGAGAAT GCACCTCAGG 960
GCTCCTAAAC TTTCACACAT ACACACACTT ACACTCAGAC ATACTTTCCC TCTCACACAC 1020
ATATGCCCAC TTACACACAC TAAGACACTA ATACACACAC ATATACAGAC ACACACACAC 1080
ATAGAGAGAG AGAGAGAGTG AGAGCGAGAT AGAGAGAGGG GGAGACTAGC GGCCCAATAC 1140
AATAATGCCT GTCAAAAAAA GAGAGAGCAG ACCAATAAAA CCATCAGTGA AGTGCCTGCA 1200
AACACACACA CACACACACA CACACACACA CACGACACAC ACGCGCACCT AGATGATTAT 1260
TAATGAATCA TTGTAAATAT ACTGATTCTT ATTGTTTTTA TTACTGTTTT ATCCTAAAAA 1320
TGTACAGTTG ATTCTGATCT ATTTTTGTAT TTTTATGAAT AATTAATGTT GAATAATAAT 1380
ATAATATATA TTGAAT 1396