EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10585 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:4100081-4102426 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr3:4100927-4100938TTTTATTGCTT-6.32
CDX2MA0465.1chr3:4101358-4101369TTTTATTGCTT-6.32
GATA2MA0036.3chr3:4101428-4101439TTCTTATCTTT+6.62
IRF3MA1418.1chr3:4100714-4100735CTCTTTCCATTTCCATTTCTA-6.37
MecomMA0029.1chr3:4101429-4101443TCTTATCTTTTCTT-6.46
Enhancer Sequence
ATTAAACCAA TAAACCCCCA AAACACTGTG GCTTATTTAC ATGGACTCTA TAACAGCTGA 60
GGGACGGTGA TGTAGAGCGC CTGAAACCCC ATTAGCTGTT ATAAATTGAC CGTAAACCAC 120
GGCTTCACAG GGTTTATTGC TTTTATAGAA CAGTTACATC AAAGACACAC TGCGGCAAGC 180
GTTCACTGAA TAAACCAGCA AATGTACTGT TTCTTTGGCT CAGTAATGAT AATGGAATGG 240
TTGCTAAGCA ACAGTCATGA GTGTGTGTTT GTACAGTATT TTACAACAGC TTTGAATGTG 300
GCTCAACCAA TAAGAATGAG AGACTGGAAA GACTGATTGG ATAAAAGCTC TTTAATGGTG 360
TTTGTAGTGG AAACCATGTG AACTTCTGAC AGAGTTTCTA TAGTTTTGTT GTTGTTGTTG 420
TTGTTGTTGT TGTTGTTGTT GTTGTTGTTG TTGTTGTTGT TGTTGTTGTT GTTAAGCAGG 480
GATATTTAGC ATTTTCTGTG CTTACAAACT TTTTATTGTA TAATTCTTTT GTATGATATT 540
CAACTCGGTT CCATGTAGTT CACATCTATT CTAATCTGTT CTGTTCTGTT TTGTTCTGTT 600
TTATTCCATT TCTTTCTATT GTATTCCACT GTACTCTTTC CATTTCCATT TCTATACTAT 660
TTTATTCATT TCTATTCTGT TCAGTTCCAT TTTGTTTTTA TTATATTGTA TTCCATTTCA 720
TTTTTTGTAT TATAGTCTGT TCTTTTCTAT TTAGTTCTGT TCTATTCTAT TCTAATTTTC 780
TCGGTTCTGT CCCATTCTCT TCCTTTCCAA TCTATTCACT GTTCTGTTCT GTTCCATTCT 840
ATTCTCTTTT ATTGCTTTTC ATTCTATTCT ATTCTATTAT GTTCTGTTCT TATCAGTTCT 900
TGTTTATTCT GTTCTATTCT ATTCTGTTCA CTTAAATTCT ATATTATTCT ATTATGTTCT 960
GTTCTATTTT TTCTGTTCTA TTCTATTCTA TTCTGTTCGA TTGTATATTA TTCTTTTCTG 1020
TTTTGTTCTA TTCTATTCTG TTCCATTTTA TTCTGTTCTA TTGTATTGTA TTGTATTCTA 1080
TTCTGTTCTG TTCTAGTCTA TTGTTATTTT TATTCTCTTC TATTCTAGCG TACACTATTC 1140
TATTCTGTTC TATTTCATTC TATTCTGTTC TATTGCTCTA TTTTATTCTG TTCTATTCTA 1200
TTCTAATTTT CTTGGTTCTG TCTCATTCTC TTCCTTTCCA ATCTATCCAA TGTTCTGTTC 1260
TGTTCCATTC TATTCTCTTT TATTGCTTTT CATTCTATTC TATTCTATTC TATTCTATTC 1320
TATTCTATTC TACTCTGTTC TGTTTTGTTC TTATCTTTTC TTTTTATTCT GTTCTATTCT 1380
ATTCTGTTCA TTTCAATTCT ATATTATTCT ATTATGTTCT GTTCTGATCT ATTGTATTCT 1440
GTTCTCTTCT GTTCTATTCT TTTCTGTTCT CTTCTGTTCT ATTCTTTTCT GTTCTATTCT 1500
ATTCTATTCT GTTCTGTTCT GTTCTGTTCT ATTCTGTTTG ATTCTATATT ATTCTATTCT 1560
GTTCTGTTCT GTTCTATTCT GTTCTATTCT ATTCTGTTCG ATTCTATATT ATTCTATTCT 1620
GTTCTGTTCT ATTCTGTTCT GTTCTATTCT GTTCTATTCT GTTCTATTAT ATTCTATTCT 1680
GTTCTGTTCT GTTCTGTTCT ATTCTGTTCT ATTCTGTTCG ATTCTATATT ATTCTATTCT 1740
GTTCTGTTCT ATTCTGTTCT GTTCTATTCT GTTCTATTCT GTTCTATTAT ATTCTATTCT 1800
GTTCTGTTCT GTTCTGTTCT ATTCTGTTCT ATTCTGTTCG ATTCTATATT ATTCTATTCT 1860
GTTCTCTTCT CTTCTCTTCT GTTCTATTCT ATTCTATTCT ATTCTGTTCT GTTCTGTTCT 1920
CTTCTGTTCT GTTCTGTTCT GTTCTGTTCT ATTCTATTCT GGTCTGTTCT GTTCTGTTCT 1980
ATTCTGTTCT GTTCTGTTCT ATTCTGTTCT ATTCTATATT ATTCTATTCT GTTCTGTTCT 2040
ATTTTATTCT GTTCTATTCT GTTCTATATT ATTCTATTCT GTTCTGTTCT ATTCTGTTCT 2100
ATTTTATTCT GTTCTATTCT GTGCTGTTCT AGTCTATTGT TCTTTTTATT CTGTTATTTT 2160
CTAGTGTACA CTATTATATT CTGTTCTATT TCATTCTATT CTGTTCTATT GCTCTATTTT 2220
ATTCTGTTCT ATTCTATTGT TATTTTCTCT ATTACACTAT TCTATTCTGT TCTGTTCTAT 2280
TCTGTTCTAC TTTATTCTGT TCTATTCTAT TGTTATTTTC TATTGTACAC TATTCTATTA 2340
TGTTC 2345