EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10580 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:2663226-2664630 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF14MA0740.1chr3:2664502-2664516GGACACGCCCACTA+6.34
PBX2MA1113.1chr3:2664382-2664394GCTGTCAATCAC-6.92
PBX2MA1113.1chr3:2664483-2664495CCTGTCAATCAC-7.22
PBX3MA1114.1chr3:2664480-2664497CCACCTGTCAATCACAG-6.3
RREB1MA0073.1chr3:2664140-2664160ACACCAAACACACACACACA+6.41
SP8MA0747.1chr3:2664503-2664515GACACGCCCACT+6.37
Enhancer Sequence
CAAACATCTC CCTTTAATAA AACCTGTTTG CTCTTCAGAT ATTAAATGGG GGAGTTTCTT 60
TTCAACATGG ATAGCCAACA CTTTTACTAA GATTTTTGCA TCAGCATTTA GTAATGAAAA 120
GGGCTTTTGA GCTATAAGAG GTGGGATCTT TTCCTTTTTA AAAAGTAATA TAATGGAAGC 180
TTNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 240
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNAGACACAC ACAAAAAATC 300
AGTGACACGC ACAACATCAG ACACACACAC ACAACATCAG ACACACACAC ACACACATAA 360
CATCATATAT ATACTCAAAT AAAATCAGAC ACACAAACAA GACCATACAC ACACAACATC 420
ATTTATACAC ACAAACATGA AATCAGTAAC ACACACATAA CAACACACAC ACACACACAC 480
ACAACATCAC ACACAAAAAA TCAGACAAAC ACAAAACATC AGAACACACA CATCAGACAC 540
ACTCACACAT CATACACACA CACACACACA CACAACATCA GACACAAATT TAAACACACA 600
CACCTGGCAT CAGGCCACAC ACAGCATAAC ACACTCACAC AACATCAGAC TCACACAGAA 660
TCAGACACAC AAACACAAAC ACACACACAA CATTAAGCCA CAAGTACACA CAATTTTAGA 720
CAAACACACA CACAAACACA CACACACACA AACACATATA TGACATCAGG CCACACACAC 780
ACAACCTCAC ACACAAAACA TCAGACCTAA ACAGCATCAG ACACACACAC AACATTAAAA 840
ACACACACAC ATAACATCCG ACATACACAC ATGACATCAT GCCAAACCCA CACACAACGT 900
CACGTACAAA CACAACACCA AACACACACA CACATTATAA AGTCACACAC AACATCACAG 960
TTACACAACA TTAGACAAAC ACATACAGCA TAAGACAGAG ACAAAGCATC ACACACACAC 1020
ACACACATGA CATCAGGCCA AACATACACA CAACATCCCA CACACACAAC ATCAGACACA 1080
CACTGACACT GACTTCATTT CCCGAGCTCT GCGCTCTGTT TCTCTCAGTG TGTGTGTCCT 1140
CCAGGGCTGC GATGGCGCTG TCAATCACCT CAGCACCTGT GTGAAGCGGT AGTGAGGGGG 1200
CGGAGTCAGT GTCTGAGCGT TTCTCCACCT CCACCAACCT CTTCCTGAGC TGCTCCACCT 1260
GTCAATCACA GCACATGGAC ACGCCCACTA TGATATGGTC ACTGAAGGAT GTCAACAAAC 1320
CATCCGAAAC TCCTGTCCAG AAAACACACA CGACTGAAGA GTTTCTGCAG GTGTGTGTGT 1380
GTGTTTGCGT GTTAAACCTC AGTG 1404