EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10577 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:2025651-2027161 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr3:2026641-2026653AAACATATGCTA+6.32
NFYAMA0060.3chr3:2025713-2025724TCTGATTGGCT-6.32
ZSCAN4MA1155.1chr3:2026783-2026798CGCACACACTGAACA+6.07
ZSCAN4MA1155.1chr3:2026437-2026452AACACACGCTGAAAA+6.71
Enhancer Sequence
TATGGCGATG CTGAACAACA CAGCAGTGTG TGTGTGACAC ATTTCTGAGC GTGTAGGTTC 60
ACTCTGATTG GCTGAGAACA AAATCATGAC AGCGCACATC GCTACGCTCT CTGCATTTCT 120
GCATTAATTA TGTGTGTGTG TGTGTTTGTG TGTTGTCCTG CATATCTGCA TGTGTGTGTG 180
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGCTGAGA GCTGAGGCTG ATTTCTAATT CCCCTGATTT 240
AATCATCTGT GTGATACTTT GGTCAAACAA AGAGACTCAT TGAGCTCCGG CTGAGCGAGG 300
GGAGGGAGGG AGGGGGTCAG ACCTGCAGTT TCACTGAATA CAAAGACACA CACACACACA 360
CACACACACA CACACAGAGG GAGAGAGAGA GACGTGCACA TAGGCAGAGA TGCGCACACA 420
CATTCTCACA TACACAGTAG CATGTACACA CTCACACTGA ACACAGAGAA AATCACACAC 480
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACTCACAT TGAAAAGACA 540
CACATATACA GAGGCGTGTA CACACTCACA TTGACACACA CATGCCTATA CAGAGATATG 600
TACACACGCA CAAAGACATG AACACACTCA CAGACATGTA CACAATCACG CTAAACACAC 660
ACACACACAC ACATAGACAG ACAGACATTA ACACACTGAA AAACACACAC ATGTACAAAC 720
TCAAGTTAAT TACACACATA CGCACACACA GAGACGAACA CACACACACA TATAAACACA 780
GACATTAACA CACGCTGAAA ACACACTGAA CACACACACA CACACACACA CATAGAGACA 840
TGTGCACAGA CATGAACACA GATATATATA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 900
CACACAGATG CGCACACAGA GACATGTTCA CACGCTAAAC ACACACACAC ACACACACAC 960
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC AAACATATGC TAAGCACAGA CACACACACA 1020
TAAACAGAGA TGCAAACACA CACACACACA CATATGTACA CACTCACGCA ACTAGAGCTA 1080
GCAGGAGAGA GAGACACACA CACACCCATG CAAATGCAGA AATACACACA CACGCACACA 1140
CTGAACAGAC ACATATACAC ACACTGAACA GACACACTCC TAATCACAAA AGAGTGACTA 1200
CACACACACA CACTCACGCA TACACTAATA CACGTACACA CACAAACCTG CAAAAACACT 1260
GATATAACAC TCATACCTAA CAGAAACACA ATAACACTCA CACAAACATT ATTAAGAGAC 1320
ATTATTAGAA GACATGGGAT CAGCTTTCAC TGCTATGCAG ATGATACTCA ATTATATATT 1380
TCAACTAAAC CTGAGGAGAC GTCTGAACTG TCTAAACTAA CTGAGTGTAT TAGAGATGTT 1440
CAAGACTGGA TGAACAACAA TTTCCTTCTC TTAAACTCCG ACAAAACAGA ATTATTACTT 1500
ATTGGGCCTA 1510