EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10576 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:2007125-2009230 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRTA2MA1478.1chr3:2009107-2009119AATTGATACAAT+6.22
DMRTC2MA1479.1chr3:2009107-2009119AATTGATACAAT+6.27
NR2F2MA1111.1chr3:2007206-2007217TCTGACCTTTG-6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:2007420-2007435TGACCTTCTGACCTC-7.52
RARAMA0729.1chr3:2007417-2007435TATTGACCTTCTGACCTC-7.63
RarbMA0857.1chr3:2007420-2007436TGACCTTCTGACCTCA-6.88
RargMA0859.1chr3:2007419-2007435TTGACCTTCTGACCTC-7.57
Enhancer Sequence
GTGTGTCAGG TGAGTCTCCC CCACAGGTAA GGAGTGTGAG CATCAGCAGA ATCATGAGCT 60
CATGATCGCT CCAGCAGTGT GTCTGACCTT TGTGAGCGCG CTCAGTGTCT CCGAGCAGGA 120
ATTCCCCACA GCGGACAACA GGACAAAACC TCTCACTGCT ACATGATCAA TCCTCCACCC 180
ACTGCCCGCT GCACTTCCTG TCTCACACAC ACACACACAC ACACACACAC AAGCAGAGCC 240
AGTGCCATCA GGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TCATGGGACA TGCGTGTCCT CCTATTGACC 300
TTCTGACCTC ACAAACATCT TTCTCTGACA TCCCAGAGAC CATCTCCAAC GGCAACCAGC 360
CACATCATCA CTGTCACATG CTGCATGACT GCGCACACAC ACATACAAAT ACACACACAC 420
ACACACTTTC TCGCTCACAC AAACATATTG ATTCACATTT ATACACACAT TTAAACACAC 480
AAACACATTT AAATACACAC ACACAAACAC ACACACACAC GCACACACAC ACTTTCTCAT 540
ACTCACACAC ACATTAAAAA ACACACATGC ACATTTAAAC ACACAATCAA ACAAACACAT 600
TTAAGTACAT ACACACACGC ATACTATCAC AAAAACACTC TCTCACACTT CCACACACAC 660
ACTGATTCAT TTTCATGCGC AAACACACAC ACATACTATC ACGCACTCTC TCACTTAAAC 720
ATACACACAC ACTGATTCAC AATTGATGGC ACAAAAACAC ACTCATAAAA TCACAAACAA 780
ACACTCTAAC ACTTACACAC ACACTTACAT TTTCATGCAC AAACACACAC ATATCACATA 840
AACACACTCT CTCACCCTTA CACACATTGA ATTACATTTT CACACACGAA CCCACAATCA 900
TACAATCACA TACACACTCT CTCTCACACA CACACACACC CCGATTGACA TTTTCATCCA 960
CACACTCATA CAATCACATA CACACACTCA CTCTCTCCCT CTCTCTCTCT CTCACACACA 1020
CACACACACA CAATTCACAT TTTGATGCAA AATAACACAC ATATCACATA AACACACTCT 1080
CTTACACTTA CACACATTGA ATCACATTGT CACGCACACA CACTCATACC ATCACATACA 1140
CACTCTTCTA CACTTACACA CACCAACTCA CATTTTCACA CACAAACACA CACTAATTCA 1200
CATTTTCACA GACAAACACA CACTCATACC ATCACATACA CACACACGTC GATTCACATT 1260
GCATATACAC ACTCTCTCTC TCTCAAACTT ACACATCACA ATTCACATTT TCACACACAA 1320
ACACACTCAT ACCATCACAT AAACACACAC ACACTAATTC ACATTTTTAC GCACAAACAT 1380
ACTCATACAC ACTCTTTCAC ACATGTCCCA TTTTCACGCA CAAACACACT CATACCATCA 1440
CAAACACACA CAAACACTCA TCAAATACAA TCTCTCATGC TCACACACAC ACACACACAC 1500
CAATTCACAT TTTTACGCAC AAACACACTC ATACCATCAC ATAAACACAC ACACACACAC 1560
ACACCAATTC ACATTTTTAC GCACAAACAC ACTCATATCA TCACATAAAC ACACACACAC 1620
ACACCAATTC AGATTTTTAC GCACAGACAC TCATACCATC ACATAAACAC ACACACACAC 1680
AAACACACAC ACACCAATTC AGATTTTTAC GCACAAACAC ACTCATATCA TCACATAAAC 1740
ACACACAAAC ACACTTATTC ACATTTGCAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 1800
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ATTATCCTAT AAACTGCGCA 1860
CAACACTAAG CACCAGCAGT TTTAGTTTGC TGAAGCATCA GTTTGTAACA GAATAACTCA 1920
GCCTCCTCAT GATCTCCTCT TCGCTGCTCA TTCAGGCACA CACACTCTCT TGATCAGAGA 1980
TGAATTGATA CAATTAATTA TGTTTTTGTG TGCGTATTTC TTTATTAAAT CACGCAGACG 2040
CGCGCAGTTT TATCTCTGCG GTAATGCGGA TCATAATAAA CTCGTGATTA AAAAACTAAT 2100
TACAC 2105