EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10569 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:1471921-1473072 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
SP1MA0079.4chr3:1473037-1473052TGTGGGCGGGGCTTA-6.97
SP2MA0516.2chr3:1473036-1473053CTGTGGGCGGGGCTTAT-7.55
SP4MA0685.1chr3:1473035-1473052TCTGTGGGCGGGGCTTA-6.45
Enhancer Sequence
TAATGCTAAC AGCAGAGGGA CATCGCTAAT GCTAACAGCA GACGGACATC GTTAATGCTA 60
ACAGCAGAGG GAGATTGCTA ATGCTAACAG CAGAGGGAGA TCGCTAATGC TAACAGCAGA 120
GGGAGATCGC TAATGCTAAC AGCAGAGGGA GATCGCTAAT GCTAACAGCA GAGGGACATC 180
GCTAATGCTA ACAGCAGAGA GACATCGCTA ACGCTTACAG CAGAGGGACA TCACTAATGC 240
TAACAGCAGA GGGACATCAC TAATGCTAAC AGCAGAGGGA CATCGCTAAT GCTAACAGCA 300
GAGGGACATC GCTTATGCTA ACAGCAGAGG GACATCGCTA ATGCTAACAG CAGAGGGACA 360
TCGCTTATGC TAACAGCAGA GGGACATCGC TAATGCTAAC AGCAGAGGGA CATCGCTAAT 420
GCTAACAGCA GAGGGACATC GCTAATGCTA ACAGCAGAGG GACATCGCTA ATGCTAACAG 480
CAGAGGGACA TCGCTAATGC TAACAGCAGA GGGACATCGC TAATGCTAAC AGCAGAGGGA 540
CATCGCTAAT GCTAACAGTA GAGGGACATT GCTAATGCTA AAGGCAGAGG AAGATGGCTA 600
ATGCTAACAG TGGACGAAGA TGGCTAATGC TAACAGTGGA GGAAGATAGC TAATGCTAAC 660
GGTAGAGAGA CATGGCTAAT GCTAATAGCA GAGAGACATG GCTAATGCTA AGGACAGGGA 720
GACATGGCTA ATGCTAACGG CAGAAAGATG GCTAATGCTA AAAGCAGAGA GACATGGCTA 780
ATGCTAAAAG CAGAGAGACA TGGCTAATGC TAATGGCAGA GAGACATGGC TAATGCTAAT 840
GGCAGAGAGA CATGGCTAAT GCTAATGGCA GAGAGACATG GCTAATGCTA ATGCTATTGT 900
AAGATAAAGA TGGCCAATGC TAATGGCAGT AAGAGACAAT TAATGCTAAC ATCAGACTGC 960
CAATGTTAAC AGCAAAGAGA CATCGCTAAT GCTAAAGGCA GAGCAAGATG GCTAATGCTA 1020
ACAGCTGTGT TATAGCCACT CCATTATTCA CGTCCATGTC CCTGTAAACC ACATGCTCCT 1080
GGTCACCGCT AGCACAGCTC CAGCAGTCTC TGCCTCTGTG GGCGGGGCTT ATGTAAATGA 1140
GGGAGCCTGT G 1151