EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10567 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:1099413-1100004 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATOH1(var.2)MA1467.1chr3:1099464-1099474GACAGCTGTT-6.02
BHLHE23MA0817.1chr3:1099853-1099865AAACATATGCTG+6.04
FOXB1MA0845.1chr3:1099944-1099955TTATTTACATA-6.02
NFYAMA0060.3chr3:1099438-1099449TCTGATTGGCT-6.32
POU4F3MA0791.1chr3:1099948-1099964TTACATAATTAATAAA+6.04
Rhox11MA0629.1chr3:1099975-1099992ACAACGCTGTTAAGCAT+6.51
ZNF24MA1124.1chr3:1099933-1099946GAATGAATGAATT-7.22
ZNF24MA1124.1chr3:1099929-1099942AAATGAATGAATG-7.34
Enhancer Sequence
GGGGCGGGAC TTAACATCGG TTTTTTCTGA TTGGCTAGTG AGATTTTGAT GGACAGCTGT 60
TGCTCCTGGA TGTAGAGATC AGTCCTGATA ATAGGAAAGT GTTTACTGAT TTATGCAGAG 120
AAATGTTTCA TGTGTTGCTT GCTTATTATT AGTGACATAA ACAATGGATT TAGGAGAAAT 180
CGACAGTATA TTATTTACCT AGGAGAAGCA GTGGCGCAGT AGGTAGTGAA GGTCGCTGGT 240
TTGAGGCTCG GCTGGGTCAG TTGGCGTTTC TGTGTGGAGT TTGCATGTTC TCCGGTTCTC 300
CGGATGCTCC GGTTTCCCCC ACAGTCCAAA GACATGCGGT ACAGGTGAAG TGGGTAGGCT 360
GAATTGTCCT TAGTGTATGA GTGTGTGTGA ATGGATGTTT CCCAGAGATG GGTTTCAGCT 420
GGAAGAGCAT CTGCTGGGTT AAACATATGC TGGATAAGTT GGCGGTTCAT TCCACTGTGG 480
TGACCCCAGA TTAATAAAGG GACTAAGCCG AAAGGAAAAT GAATGAATGA ATTATTTACA 540
TAATTAATAA ATGCATCTCT CTACAACGCT GTTAAGCATA TTACATGCAA G 591