EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10560 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:560774-562072 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ZSCAN4MA1155.1chr3:561304-561319GTTTCAGGGTGTGTG-6.34
ZSCAN4MA1155.1chr3:561605-561620GTTTCAGGGTGTGTG-6.34
ZSCAN4MA1155.1chr3:561572-561587GTGTAAGTGTGTGCA-6.4
ZSCAN4MA1155.1chr3:561400-561415GTTTCAGTGTGTGTG-6.59
ZSCAN4MA1155.1chr3:561511-561526GTTTCAGTGTGTGTG-6.59
Enhancer Sequence
GATGAAGGCG GAGCCACAGA GAGGATGAAA AGAAGAGGCG GAGCTCCACT CCACTGCACA 60
CACACACACA CACACAAAGA GATAAACACA CGTGCTGATG AACACAAAGA GATAAACACA 120
CACACAGGTG AAGGTGTGAC CTGTACACAC TGCGTCTCAC CTCTGTATCT GCTGATGAGT 180
CCGTGTGTGT GACCGAGAGG CTCGCTGACC CGCACACACA CACTGCTGTC TCCCGTCACC 240
TGCAGGGCGG CGCCAGCGGG CGGAGGGGGC GGAGCTACAG GACAGATGGA CAGCTGATCA 300
CACCTGTGTG TGTGTGTGCG TGTGTGTGTG AGTTTGAGTC AGTCAGTGTA TGTTTGTGTG 360
TCTGTGCAGT ATATATTTGA GTGATTGTGT GTGTGTGTGT TTTGAATTAT TCTGTTTGTG 420
TACGTGTACG TATGTATTTG GAATTATGCA GAGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 480
GTTTTATGTA AATGTTAGTG TGAGTGTGTG CATGTGAGTT TGTATTGAAT GTTTCAGGGT 540
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTATGTGTGT GTGAGTCTGT GTGTTTTGAA TGTTCCAGTG 600
TCTGAGGGTG TGTGTTTGTT TTAAATGTTT CAGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTGTTT 660
TAAATGTTTC TGTTTGTGTG TGTTTGTGTG TGTGTGTTAA TTGTTTCAGG ATGTAATTGT 720
ATGTGTTTGT TTTGAAAGTT TCAGTGTGTG TGGGTTTGTG TTTGTGTGTG TGTGGGTGTG 780
TGTTTTATAT GAATGTTAGT GTAAGTGTGT GCATGTGTAT TAGTATTGAA TGTTTCAGGG 840
TGTGTGTGTG TGTGTGTTCT GAATGTTTAA GTGTGTATGT GTGTGTTTGT TTTAAATGTT 900
TCAGTGNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 960
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNCAGA CATGCACTTA 1020
CACATATACA CGCACACAAA CACACACATG CACACAAACA CTTTTAAATA CTTACACACA 1080
CACGCACGCA CACACACTTA CATGCAGTCA TTTACACGCA TATATACACA CACACACACA 1140
TACACACACA AACTCACACA CACATACACA AAGCCAGTGT TCCTGCAGTG ATGTCATCTG 1200
ACCTGTTTGT GTCTCTCTTT CTCCGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1260
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTATGTGC GCGTGTGT 1298