EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10557 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:60855-62681 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:61844-61856GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:62192-62204GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:62268-62280GTTTGTTTGTTT+6.32
POU1F1MA0784.1chr3:61482-61496CTCATTAGCATAAA-6.64
POU3F1MA0786.1chr3:61483-61495TCATTAGCATAA-6.22
POU3F2MA0787.1chr3:61483-61495TCATTAGCATAA-6.44
Stat6MA0520.1chr3:60923-60938CATTTCCACAGAACT+7
Enhancer Sequence
AGTGTGTGTG TGGGAGAAAA CACACACACA CACCGAGAGA GAGAGAGAGA AAGACCAGCA 60
TCCCAAGACA TTTCCACAGA ACTCGGCCAT ATAAAATACT GAGAAGACAG AATAGATGAC 120
GCTGGAGGCA GTGTGGGCCG ACTAAAGCGC TTTACACTGA TGTTTGAGCA TACTAAATAC 180
ACACACACAC ACACACACAC ACACATTAAG AGTCTAAATT AAAACAGAAA GCCAGCCTGA 240
GCTGTACAGT ACACACCTAC ACATGTCTCC ATTCAACAAA TTCTTCATTA TTAATTTATA 300
TTCTCAGTGT TAGAAGCATT CCTGCAGGCT TCAGTGTTAT TTTAGGTGTG TGTGTGTGTG 360
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTTTA TTGATCTTAA AGGGCATCTA 420
TTATGCTGAG ATGACTGGTT TAACCGCAGC AGTGTGTCAG CATGTGTGAG TATCTCCAGT 480
CTCTGATGCT CATCGTGAGT TAACCGTGTT TGTTCTAATC AGACTTGATG CTGAAACACT 540
TTGATTGACA TTCTCCCTTT GTATGATGTC ATTGGAGGGG GAAAGCCAGA GGGGGAAAGC 600
CAGGGAGAGA CTAGTGCCCG TCTCTCCCTC ATTAGCATAA ACAGCAGCCC TCTGTGAGAC 660
AGGAGTCTCT ATAGACTGAA GCATTCTCAC ACACTGATGC TCACATTTAC CTGTGTGTGT 720
TTTTACACGG GCACGTGTGT GTGTCTGTTT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTTAT 780
TTGTTTGTAT GTGTGTGCGC ACTTGAATTT CTGTGTGTGT GTCTGTGTGT CTGTTTGTGT 840
GTGTGTGTGT GTGTGTGTTT ATTTGTTTGT ATGTGTGTGC GCACTTGAAT TTCTGTGTGT 900
GTGTGGTGTG TCTGTGTGTG AGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTA TTTGTGTTTG 960
TGTATATGTG TGCATCTATG ACTGTCTGTG TTTGTTTGTT TGTCTGTGTG TGTGTGTGTT 1020
TGTGTGTATT TGTCTGTGTG TATGTGTCTG CGTCTATGTC TGTCTCTGTG TGTGTGTGTG 1080
TGTCTGTGTG TGTGTGTATT TGTGTTTGTG TATATGTGTG CGTCTATGTC TGTCTGTTTT 1140
TGTTTGTTTG TCTGTGTGAG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTATT TGTCTGCGTG 1200
TATGTGTCTG CGTCTATGTC TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGCG CGCACTTGTA 1260
TTTCTCTGTG TGTGTGTTTG TGTGTATGTG TGTGCATCTA TGACTGTCTG TGTGTGTGTG 1320
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTT TGTTTGTTTG TATCTGTATG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1380
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTTTGTA TGTGTTTGTT TGTTTGTCTG TATGTATGTA 1440
TGCGTGTGTA TGTGTGTGCG TCTATGACTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1500
TGTTTGTCTG TATCTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGCGTG TGTGTGTTTG TGTGTGTTTG 1560
TCTGTATCTG TGTGTATATG GGTGCGTCTA TGACTGTCTT TCTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1620
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGCNNNNNNN NNNNNNNNNN 1680
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1740
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNTATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATAAATAA 1800
ATAACATTGT GAATAAATAC TAACAT 1826