EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10556 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr3:106-1109 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYAMA0060.3chr3:611-622GACCAATCAGA+6.14
ZNF143MA0088.2chr3:866-882TGAGGCATTCTGGGTA-6.14
ZSCAN4MA1155.1chr3:287-302GTTTCAGTGTGTGTT-6.45
ZSCAN4MA1155.1chr3:162-177GTTTCAGTGTGTGTG-6.59
ZSCAN4MA1155.1chr3:242-257GTTTCAGTGTGTGTG-6.59
Enhancer Sequence
GTGTGTTTGT TTTAAATGTT TCAGTGAGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTT TTAAATGTTT 60
CAGTGTGTGT GTGTGTGTAT GTATGTGTTT GTTTTAAATG TTTCAGTGCG TGTGTGTGTG 120
TGTGTTTGTT TTAAATGTTT CAGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT TTGTTTTAAA 180
TGTTTCAGTG TGTGTTTGTT TTAAAAGTTT CAGTGAGTGT GTGTGTGTGC TTGTTTTAAA 240
TGTTTTAGTG AGTGTGTGTT TGTTTTAAAT GTTTCAGTGT ACGTGTGTGT GTGTGTTCAT 300
ACTCGTCCTG TTGAATCTCT CCCTCATGTT CTGGTAAAGC TCTCGGCGGC GTCTCCACTG 360
CTCCACGTTC TTCTGTGCGT CTGTGTGTGT CTGAAGCTCC GCCCTCACTC TCACCTGAAG 420
CTCCGCCTTC TCTCTGACCT CAAGCTCCGC CCTCCACTCC TCCAGCTTCT GCTCAGCCAA 480
TGACACCAGC TCATCCAGCT TCAGCGACCA ATCAGAGGCC GAGATCACTG CAGTCAGAGG 540
CATTCATAAT TCAGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTCTCTT TGTATGTGTG TTTGACGGAT 600
TGTGTGTGTG TATGTCTCTC TGTACGTGTG TGTCTCACAG GTAATATTGT GTTCATGTTT 660
GTCTTCTGCA TCATGCTTTG TGTGTTGTGT GTGTGTAATG TGTGTGTCTC TCACAGGTAG 720
GGTTGTGTTT GGCTCCGGCC TTCAGCAGCA CCTTCAGCAG TGAGGCATTC TGGGTAAGAA 780
GAGCCACATC CAGCGGCACC AGGCCAAGTT CAGTCACCCG GTTCACTCGT CGGTGTGTGT 840
GTGTGTCCGT CGCTTGTTCT CTGGACAGCA GATGCTGGAC GCCGAGTGTG TCTTCATTCT 900
CCAGTGCATC CCACAGACTC CAGAACTAAA CACACACACA TGCACACACA CACACTTATG 960
CAGACTGCAG TACATTTACT CTATATGTTT GTGTGTGTGT GTG 1003