EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10544 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr25:36628123-36630087 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr25:36628539-36628556GTTGATTAATTAATTGG-7.26
Alx4MA0853.1chr25:36628539-36628556GTTGATTAATTAATTGG-6.78
FOXE1MA1487.1chr25:36629420-36629435ATTGTTTGTTTAATT-6.56
Hmx1MA0896.1chr25:36629112-36629129ATTGATTAATTGGTTGG-6.09
Hmx2MA0897.1chr25:36629377-36629394ATTGATTAATTGATTGA-6.14
Hmx2MA0897.1chr25:36629112-36629129ATTGATTAATTGGTTGG-6.93
Hmx3MA0898.1chr25:36629424-36629441TTTGTTTAATTGATTGG-6.03
Hmx3MA0898.1chr25:36629377-36629394ATTGATTAATTGATTGA-6.45
Hmx3MA0898.1chr25:36629112-36629129ATTGATTAATTGGTTGG-6.72
NFYBMA0502.1chr25:36628660-36628675GTGATTGGTTGATTT-6.09
NFYBMA0502.1chr25:36628906-36628921CTGATTGGCTGATTG-6.94
NFYBMA0502.1chr25:36629030-36629045CTGATTGGTTGATTG-7.19
PBX1MA0070.1chr25:36628756-36628768AATGATTGATGG-6.07
POU6F1MA0628.1chr25:36628543-36628553ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr25:36628543-36628553ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
CTACAGAACT GAACGCAGAG GTTCTGGATG CATGAGCAAA TCCACAGAAC AGTACTGGTT 60
TATATTAGTA TGACAGACTC AAACTGCTGA GATTGGGTAC TGCGACTGCA CCTGCGTGAG 120
GAGAACAACA CTGAGCTAAA CAAATACTTG AGCTACTGGA GGAGAGTTCA CGATCTGTGC 180
ACAGCAGAGC TAATGCAGGT GAAATGACAC GCACTGGAGT AAAACTGAAC TGATGAAGTG 240
TCCTGCATAT AACATTTGCT CTATATAAAC ACTGACCACA AAACAAACTG ATCACTGGCT 300
GCTTTGTGGA GTAGGTTAAC TGGTACTGAT TGATTGATTG GCTGATTGAT TGATTGGTTG 360
TTTGGTTGGT TCATTGATTG ATTGGTTGGC TGATTTATTT ATTGATTGGC TGGTAGGTTG 420
ATTAATTAAT TGGCTGATTG ATTGATTGGT TGGCTGGTTG AATAATTGAT AGGTTGGTTG 480
GTTGGTTGAC TGCTTGATTG ATAAATTGAT TGGTTGATTA ATTGTTTGAT TGGATGAGTG 540
ATTGGTTGAT TTATTTAATT GATTAATCGA TCAATTGATT GGTTAGTTGG TTGATTAATT 600
GATTGGTTGA TTGATAACTT GGTTAGCTGG TTAAATGATT GATGGGGTTG GTTGATTGAT 660
TGATTGTTTG ATAAATTGAT TGGTTGGTTA GTTGAATAAT TGTTTGGTTG ATTGGTTGGT 720
TGATTGTTTG ATTAATTTAT TGGTTAATTA TTTAATTTAT CAATTGATTG GTTGGTTGAT 780
TAACTGATTG GCTGATTGAT CGATTGGTTG GCTGGTTGAT TGATTGATTG GTTGATAAAT 840
TGATTGGTTG GTTGTTTGAA TAATTGTTTG GCTGATTGAT TGGTTGGTTG GTTGATTATT 900
TGGTTGGCTG ATTGGTTGAT TGATTTATTG GTTTTTTATG TATTTATTGA TTGATCAATT 960
GATTGGTTGG TTGATTAATT GATTGACTGA TTGATTAATT GGTTGGCTGG TTGACTGATT 1020
AGTCGGTTGG TTGGCTGATT GATTGATTGG TGGGTCGGTT GGTTGATTGA TTGGTGGGAC 1080
GGTTGGTTGG TTGGTTGGTT GATTGATTGG TGGGTTGGTT GGTTGATTGA TTGGTTGGTT 1140
GGTTGGTTGG TCGGTTGATT GGTGGGTTGA TTGACTGATT CATTGTTTGA TTGGTTGACT 1200
AATTGATTGA TTGGTATGTT AGTTGAATAA TTGTTTGGCA GATTTAATTG GTTGATTGAT 1260
TAATTGATTG ATTATGGATT GATTGGCTGG CTGATTCATT GTTTGTTTAA TTGATTGGTT 1320
AGTTGATTAA TTGATTCGTT GGTTTGTTTA ACTGATTAGT TGACTGACTG ATTGATTGAA 1380
TAATTGGTTG CTAGATTAAT TGGTAGACGG GTTAATTGAT AGACTGACTG ATTGACTACT 1440
AGATTGACTG GTTGTTTGGT TATTTGGTTG TTAGAGCGGC ATGGTAGGTT GTAGTTGGTT 1500
AGTAAAGTAG ACTGGTTTGT ATGTACGTTG TTGGGTGGAT GGCATCTTGT TTCTACATCA 1560
GAAAGCTCCA CCACTGTAGA AATAGAACTA ATCAACTGAG AAGTGAAGAC TATATTGATT 1620
TCCACTTGTG CAGCTTTAAA TATGTTAGCA TCAGTGCTTG TGTTGTAGAG TGATGATCAC 1680
CTGTGTGTGT TTTCCAAAAC TCTGAGGCTG AATCTGCTGC TCAAACAACA TATCTGGTCC 1740
TTTCCCACTG TTTTATCCCT CTCTCTCAGT TTTCGCTGGA TTCCACACAG TCCCGATAGA 1800
GCCTCTGATC CTCAGATAGG GAGCTGTAAA TGACTCACGG CTGTGACTGA GCGAGATGTA 1860
CACTAGTCTG CAATAGGATC AGAGCGGGTC AGACTGCTGC TCTAAACTGT GGGATAAAAG 1920
AGTCTTTCCA TACTGACATC CAGCTCCTAA AATAACCCGC TCTC 1964