EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10451 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr25:29128845-29130611 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hmx2MA0897.1chr25:29129000-29129017TCAATCAATTAATCAAT+6.14
Hmx3MA0898.1chr25:29129000-29129017TCAATCAATTAATCAAT+6.45
MTF1MA0863.1chr25:29130290-29130304GAGCCGTGTGCAGA-6.31
PBX1MA0070.1chr25:29129370-29129382CCATCAATCAAT+6.62
ZNF263MA0528.1chr25:29130452-29130473ACCCTCCCCCCTTCCTCCTTT-6.55
Enhancer Sequence
TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCTTCT ATTTATCTTT CTGACTACAA ATCCATTTAT 60
CCATCTTTTT GAACATGAAT CAATCAATTC ATCCATCCGT CCGTCAGTCA GTCAGTCAGT 120
CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATTAATCA ATCAATCAAT 180
CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT CAATCAATCA ATCAATCAAT 240
CAATTCTGTC TATTGACAGT TAATCAACCT TTATATCTAT CTATCAACCT TTATATCTAT 300
CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT 360
CTATCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT CTCTGTCTGA 420
CTGTCAGTCT GTCTGTCTGT CTGTCTGTCT GTCATCTATT TATCTTTCTG ACCACAAATC 480
CATTTATCCA TTTTTGAACA TGAATCAATC AATTCATCCA TCCATCCATC AATCAATCAA 540
TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA 600
TCAGTCAGTC AGTCAGTCAG TCAGTCAGTC AGTCAGTCAG TCAGACAGTC AGTCAGTCAG 660
TCAGTCAGTC AGTCAGTCAA TCAATTCTAT CTATTGACAG TTAATCAACC TATCTATCTA 720
TCTATCTATC TATCTATCTG TCTGTCTGTC TGTCTGTCTG TCTGTCTGTC TGTCTGTCTG 780
TCTGTCTGTC TGTCTGTCCG TCCGTCCGTC CGTCCGTCCG TCCGTCCGTC CGTCCGTCCG 840
TCCGTCCGTC CGTCCGTCCG TCCGTCCGTC CGTCCGTCCG TCCGTCTGTC TGTCTGTCAT 900
CTATTTATCT TTGTGACCAC AAATCCATTT ATCCATCTTT TTGAACGTGA ATTAATCAAT 960
TCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCA GATCAATCAA TCAATCAATC AATCAATCAA 1020
TCAATCAATC CTATCTATTG ACAGTTAATC AACCTATCTA TCTATCTATA TATCTATCTG 1080
TCTGTCTGTC TGTCTGTCTG TCTGTCGGTC TGTCTGTCGG TCTGTCAGTC TGTCTGTCTG 1140
TCATCTATTT ATCTTTGTGA CCACAAATCC ATTTATCCAT CTTTTTGAAC ATGAATCAAT 1200
CAATTCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCAT 1260
CCATCCATCA GATCAATCAA TCAATCAATC AATCTGATCA CCAATCAATC AATTTATGTC 1320
TAAGTCTATT ATAGATTACC TTAGTTACTT TAGATAAACC CAAATGATTT ACATAAGCAA 1380
CTATGTCTGG ATGAAGTGAG GGAAATCCTC AATAAATAAA TAAGATTACC AATCCAGCAT 1440
TACTGGAGCC GTGTGCAGAC GCATGTCTTT AACCTGATGA CTGAGTCGTT TGTATGTGCA 1500
AAGTAGGCGA ATAAAGACTC TCTTTTCTGG GTCAACTCCA AACCACAGTG TTGGTAATGA 1560
ACACCTTATG TATGTCAAAA GAAGAACTTG AATGAAGCCG CTTCCTGACC CTCCCCCCTT 1620
CCTCCTTTCC CTTATGCACC ACATTCGGTT GCATTTAGAC TCATTCATGA CAAATGGAGA 1680
CCCCAGCCCC CCTCCCATGT GTCCCATAAC AGCTGAATGA GCAACTTTCT GGCAAAGCGA 1740
GGGAAAACAC AAAATCGGTT TGACAC 1766