EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10433 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr25:25601413-25603089 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr25:25601996-25602011AATTAAACAAACAAG+6.06
FOXE1MA1487.1chr25:25602666-25602681CACAAAACAAACAAA+6.35
Foxd3MA0041.1chr25:25602963-25602975AAACAAACATAC-6.37
HLTFMA0109.1chr25:25602983-25602993AACCTTATAT+6.02
SOX10MA0442.2chr25:25602073-25602084AAAACAAAGCA+6.02
ZNF384MA1125.1chr25:25601926-25601938AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:25601927-25601939AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:25601928-25601940AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:25601929-25601941AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
AGTCACAGCC TTTGCTCAAT ACTTTGTTCA TGCACAAATC AAGCACAAGT AACCTGTGGT 60
AATATTTAAT GGTTTGAATA TGGAAAGTAG ATGTCACACA GGGAAAAAAT AATGCTTAAT 120
ATCCCAGACT CCAAACCAGT GCAAACGTTT TTTGAGGCAC AAATCTGTCA CAGTTGGCAA 180
GGAGGACCCA AACACAGAAT TGACAGGAGA ACACAAGGTT TATTTACAGT CAATAGTGCA 240
GGGTTATGGC AGAAGGACAG GCTGGTGAGG GGAGGAGACT CAGGATTTAA GGGGGTGACA 300
CGCCTGTCAG GAAAGAGGAA ATTCCAAACT TCAGGCCAAG CAGTCAATGA ATAGCTAGCC 360
GGACCTATGG TTTGGGACAG GGGTGACAAT TGGATGGATG ATCAAGTCAA GGGGATCCAC 420
AATCAGCGAA GACTCAGGAG GCAATAAGGG ACACAAGCAA CACAACAGGA CAAGACAGCT 480
GGAGAGACAA GAAAATTAAA AAGAAGAGAA AGCAAAAAAA AAAAAAAACA CTAGAACAAA 540
GTAAATATAA TAAATATTCA AAAGGGGAAA AAGCGAGAAA TAAAATTAAA CAAACAAGGA 600
ACTAAATAAA ACTACCAAAA CTTAACAAAA CGCCGAAGGA AATAAGCTAT AGCTAGAAAT 660
AAAACAAAGC AAAACACAGG AACAGGAATT TAAAAATAAA GAACTAACAA AAGATTAAGG 720
CTAGACTGGG GCTGAGGATA ACAAAAATGG CTAAATGAAA ACTTGAAATC AGTCTTGAAC 780
TACAAACAGA ATTTAAAATT GAAAATGACA GCAACCTTGC TGAAAGGCGT TCGTGACACT 840
ACCCTTACCA CCCACGCCCT CAGTTATATC CGCGTCTAGG GTGGCAGAAT AGAGAGAATA 900
GAGTTTGCGA CAGCTTCCCC TCCCCGCCCC CACTTTAGGC TTGAGGGCGA CGTGACCGTC 960
CTTTGCCTAG AGCAGCAGTT CAGCTTGCAC TGGCCCTGAC TAGACTATGT ATAAAAAACC 1020
TCTATCATGC ACTAAACAAG ATTAGCTAGA CATGCACACG AAAGATAGAA TGATGAACCG 1080
GCAAAGACAA GTGGAAAATG AACTCAATAT AAAGGGAGTA GAGAGCATGA GGAACAGGTG 1140
AACATAATTA GACAAAAAAG GACTAAACAA GGGGTAGAGG CATAGGAAAA CAAGGAGGCA 1200
GGACAAGGGG AGTACATGGC CAACACAACA AAAGAGACAA CCATGTGCTA ATACACAAAA 1260
CAAACAAAGT GAAATTAAAC ACAGACAGAA GTGACAGGGC TGTAAAGGCT GGATCCTGAC 1320
ACAACTCAGC ACAAACGTAG CACAAACGAA TAGCATATTT GGGCATTATT TATTTTTATG 1380
GGGTGCAAAC TTCATGGAGG TCACTTAACA ATAAACAAAC TAAAAGCTGA TTTCACGGTT 1440
TACTGCAACA AACAAACAAA ATAAAATCCA CTCCTAAAGC AATCCAGCTC CAACTATTTT 1500
AACTCACCAA ATGATCTTAT ACTACGTGAA TTTCTGCAGG TTGTAGACAA AAACAAACAT 1560
ACATTACAAT AACCTTATAT TTTCAATAGG ACATGAAATA TGTTTGTAAC TAAATGCACT 1620
GCTAGAGATG TTTTTAACAG AGGCTATAAA ACCATTTTGT ACTGCTAATT GCGCAA 1676