EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10386 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr25:20270570-20271453 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr25:20270699-20270711AATGTAAACAAA+6.37
FOXK2MA1103.1chr25:20270700-20270711ATGTAAACAAA+6.32
FOXP2MA0593.1chr25:20270700-20270711ATGTAAACAAA+6.14
Foxd3MA0041.1chr25:20270883-20270895AAACAAACAAAC-6.32
Foxj3MA0851.1chr25:20270697-20270714TAAATGTAAACAAATGA+6.51
TFAP2AMA0003.3chr25:20271302-20271313TGCCTGAGGCG-6.62
TFAP2B(var.2)MA0812.1chr25:20271302-20271313TGCCTGAGGCG-6.32
TFAP2C(var.2)MA0814.1chr25:20271302-20271313TGCCTGAGGCG-6.14
Enhancer Sequence
CAGACCACAG AAATTTGAGT AAGCAAACAA ACTACAGAGT AAACAAACTT GTGAATAAAT 60
TAAAGAAAAA GGAAAAAAGT TTGAGCACAA GCAAATGGAC AAACATAACA GACAAAAATC 120
TAATAAATAA ATGTAAACAA ATGACCAGCA GCACGCAAAT CAGTGAACAA CAGATGATTA 180
GACAAAAAAA AAACAATTCT TTCAGATTGA GCAAACAAAC GCACAAACAA ACAAATGGAC 240
AACAAATTTT GTACCACATT AAATTGGTCA AAGAAATGAA CTAATGGACA AACAAACTGC 300
CCATTAAACA AGCAAACAAA CAAACTTACT ATAAAATGAG TGAACATTTA GACAAACAAC 360
TCATAAAAAC AAATGAAAAA AAATGGACTT CAGATTTTTG GTATAACTTT ATAAATCCAT 420
TAGGAATGAC ACATTAGATT TATAGAAATA TAATTGAATT CAATTTCCCC CACTAGCATA 480
ACACGTTACA AGGAAGAAAA AAAGAAAGAA ATGAAAGCAG GAATTTAAAC CCCTACACTA 540
ATCAAGCACT GTGCGTTTGA GAGCACATGT CGTTTAGCAT TTCGCATGAA CCGAGCCCAA 600
CACATGGAGC AGTTCTGCCC ATCTGACCCG TCTTCATCCA GGGCTGGGTG AGGGGAGGAG 660
GGTGGGGGGT TGGCCCCGCG GGTCTCCCCT CGCTCACAGA CTCTCTGGTC GGAAAGCACA 720
GATTGCTGCC TCTGCCTGAG GCGTCTCTCA GCCTCCAGCA CATTTACCCC GCTTACACTC 780
GCCTTTCATT CACCACTAAA GCAGATGGCA ACGCGCCTCA GTCCTGCTAT TACAAACACT 840
GCAAAAACTC CAAATAATTC CAATATAGAC ATGCTGGAAT AGG 883