EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10340 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr25:15311292-15312892 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr25:15311426-15311445GAGCGCCCCCTGCTGGCCT-7.77
CTCFLMA1102.1chr25:15311427-15311441AGCGCCCCCTGCTG-6.84
Foxd3MA0041.1chr25:15311556-15311568AAACAAACAAAC-6.32
Enhancer Sequence
TGCCATGGGA TTTTTAATGA CCACAGAGAG TCAGGACCTC GGTTTAACGT CTCACCCGAA 60
AGACGGCGCC CACAGACAGT ATAGCATCTC CTTCACTTTT ACTGGGGCAT TAGGACTCAC 120
ACAGACCACA GGTTGAGCGC CCCCTGCTGG CCTCACTAAC ACCACTTCCA ACAGCAACCT 180
AGTGTTCCCT AGTGGTCTCC CATCCAGGTA CTGACCAGGC TCACCCCTGC TTAGCTTCAG 240
TCAGTAACCG ATCTTGGGCT GCAAAAACAA ACAAACAAAA ACAAAAAAGG CCATAAAGCA 300
TAGCTCCTGG GACGTCTCCA GAAATGTAGA TAGCAGTACA TTTTCAGACT GAGCCTGGGT 360
TGGACACAAG CCTTTTACAA CTGCATTTTA TGATATAATA ATAAATAATT TTTACACTGG 420
ATTTACACTG CTATTTTAAA TGAACTCTAA TTGGTTTTGT TAAGCAGTCA ATGCCTTCGG 480
ACTATCAAGA TGTGTTTATG TTTGTGTTTT CTAAAGTGTC TGACATACTC AATAACACTC 540
GTCTTGTGCA TTGTTAAACT TTAAATTATG ATGCTCTCAT AGATCACACA CCCCTACACT 600
GAATCTGCTT GTCCGAGTAA TAGAAAAATA AAACTCAAAA TCATGTTATA TTCTGTTTTA 660
TGATGCAAGT GGTGCAAAAA ATTACACACT TCAACAAGTC CTGTCACTGA ATAATCCCCC 720
AAGCTACATC CGTCCTCTCC CACATGTCCT ATGTGTCATT CCTCACCATC AGCGAGCATC 780
ATGTGTGTCC TCAATCTCAC TCCCCTCACA CAAAACCTTC TCTGCTTTCA GACGAGACTC 840
TTAGTGAATT CCCCAGGAAC CCTGATCTAC CCACTGCCCC GGGCTCCTCT TTCACAACTC 900
TGGCAGAGAC AGACGCCACC CTCACAGACA ATGTGACTAC TTCAGCCTCT ATTTCTGCTT 960
CTAACGCCAC TTCACCTGAA AGACCTGAAA ATGGTTCATC TGCTACTACA GTACAAAGCA 1020
ACTCTCACAC TGTGACCAGC GACAGTCTCC AACTCACCAC AGTGACCACC ACGACTGTCA 1080
CTCCCTTAAC TGTGACATCC ATGACTGTGA CTCCACCCAC TCCGGTCGTC ATGGTGAAAG 1140
AGGTCGAAAC CACCATGCCG ACTACAACAA CCACCCAAAC CACAACAACT GAGACAGAAC 1200
CACCAACAAC GAGTACCACC ACCACCACTA CAACAACTAC TACCACCACA ACCACAAAAG 1260
TAGCACCAAC AACTACCAAA CCCCCCACAA CCACGTTGGC AACTACCACC ACAACGACGA 1320
TGACGACTCC TCAAACCACC ACTGTTTCTA CCTCTGGAAG TACCATGACT GAACTGAGCA 1380
CCTCTCCAAC TGACAGTTCT CTGGTCTGTA ATGTGACCGA AAGGTTATGG GTGAAAACAG 1440
GTAAGCTATT GTTCACTTTG TTAGCATATA TCTGAATGTG CCTTTGTGTT GTGATAATTC 1500
ACTAAAGTAT TCATATAACC TCTCTGGATC TGCTTACACT ACTTCAGTCA TTATTTGAAC 1560
TGGTGTTTCT TGTATAGGAG TCAAGGCTTG CTAAAAAGAA 1600