EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10312 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr25:13315261-13317615 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX1MA0878.2chr25:13317424-13317435GTTTTATTGCC-6.32
CDX4MA1473.1chr25:13317424-13317435GTTTTATTGCC-6.62
HOXD9MA0913.2chr25:13317424-13317434GTTTTATTGC-6.02
SOX13MA1120.1chr25:13317591-13317602TGCCATTGTTT-6.62
Enhancer Sequence
TTATTTTTAT TATTATATGC TGTTGATATG CTATCCTTAA TGGTTAGCAT GTGGTGGCTT 60
GCTAGGATGT TCTGAACTGT TGCTATTGAG TTCTGGGGGG TTGCTAGTAA GTGGTTCCTT 120
TAGTGTTGCT AGGATGTTCT GAATAGATGG AAGTGGGTTT TAGAGTGGTA GTTAAGGTGT 180
TACTCAAATG TTCTTAATGG TTGCTAGTGT GTAAGTTGTG GCTTCGGTGT TACCAGGATG 240
TTCCAACTAA GTCCAAGTGG GTTTTAGGTT GGTAGTTAGG GTGTTCCTAA TGGATGAATA 300
TCCTTATAAA TAAAATATTC TTAATGGATG TCAGTGTGTT TTCTGTAAGA GTTAGCTAGA 360
ATGTTGCTAG GATGCTCTGA ATTGTTGCTA GGTGGTGATC TAGGTGTTTG CTAGTACACT 420
AAGTGGCTGC TTGATTATTG CAAAGATATT CTAAACTGTT GCTATTATGT TCTTGGGTGG 480
TTGCTATGTG GTTGCTTGAG TGTTGCTAGG ATGTTCTGAA GGACTGCATG TGTGTTTTAG 540
CATGGTAGTT AGGGTGTTAT AAAATGTTGC AATTGGTTGC TAGTGCTTTT TTAGTAAGAG 600
TTTGCTAAAA TGTTATTAGG ATGCTCTGAA TTGTTGCTAG GTGGTGTTCA AGATGGTTGT 660
TACGTTGTCA CTAGGATGTT CTGAACTGTT ACTACTTAGT TCTGGCATAA TGTTCTGAAT 720
GGTTGTGAGT GCATTCTGTG AGGTTGCTAA AATGTAGCTT GAATGCTCTG AATGGTTGCT 780
AGAGTGTTCT GGGTGGTTGT TGCTAGCATG GTTAGGTGGT TGCTTGGATG TTATGATTAA 840
CTACAAGTGT GTTTCAGCAT GGTAGTTAGG GTGTTGCTAA ATGTTCTTAT TGGTTGTTAG 900
TGTGATGTAA ATAAAAGTTT GCTAAAAAGT TGCTTGTATG CTTAGAATGG TTGCTAGGTG 960
GTGTTATGTG GTGGTTGCTA AAATGGAGCA ATTTATGCTC TGGTTGCTAG AGTGTTCTGG 1020
TTGGATGTTT CTAACGGTTG CTAACGTGCT CTGGGTGGTT GTTGGGATGT TGTTAGAATG 1080
TTCATAACTC CAAATGATTT TGTTGCTATT GAGGTCTGGG TGGTTGCTAG TAAGTGGTTG 1140
CTTGAGTGTT TCTAGGATGT TCTGAATAAT TGCGAATAAT TCTAAATAAA AGTGTGTTTT 1200
AGCAAGGTAG TTAGGGTGTT GCTAAAATGT TAATGGTTGC TAGTGTGTTT AAGTAAAAAA 1260
TAGCTAAAAA AATGTTGCAA GGATGCTCTG AATTGTTGCT CTGTGGTGTT TTAGGTGGTT 1320
GTTATGTTGT CACTAGGATG TTCTGAACAG TAGCTACTGT GTTCTGGCAG GTTGCTAGAG 1380
TGTTTTCAGA AAGTGGTTGC TACAGTATTG CTTGGATGTT CTGAATGATT GCAAATGTGT 1440
TTCAGGGTGG TAGTTAGGGT GTTTGATAAG TGGTTTCTAG GATGTTCTGA ATGGTTGTAA 1500
GTGTGTACTG TGGGGTTGCT AAAATGTAGC TTGAATGCTC TGAATGGTTG CTAGAGTGTT 1560
TAGGGTGGTT GCTGTTAGGG TGGTTAGGTG GTTGCTAAGA TGTTCTGAAT TACTGCAAGT 1620
GTGTTTCAGC ATGGTAGTTA GGGTGTTGCT AAATGTTCTT AATGGTTGCT TAAGAGTTTG 1680
CTAAAATGTT GCTAGGATGC TTACAAGGGT TGCTAGGTAG TGTTATGTGG TGGTTGCAAA 1740
CTCATAACTT CATAACTCCA AAAGATTTTG TTGCTATTGA GGTCTGGGTG GTTGCTAGTA 1800
AGTGGTTGCT TAAGTGTTGC TATGATGTTA TGAATAACTG TAAGTGTGTT TCAGCGTGGT 1860
AGTTAGAGTG TTGCTAAAAT GTTCATGGTT GCTAGTGTGT TTTAAGTAAG AAATTGCTTA 1920
AATGTAGCAA GGATGCTCTG AAATGTTGCT AAGTGGTTGT TATGTTGTCG CTAGGATGTT 1980
CTGAACTGCA ACAATACTGT ATGCCACATT ACATATGCTC TGGTTGCTAG AGTGTTCTGG 2040
TTGGTGGTTA GGGTGCTGCT AAGGTGGATG TTCCTAATGG TTACTAACAT GCTCTGGGTG 2100
GTTGTTGGGA TGTTGGGAGG ATGTTAATAA CTCCAAAAGA TTTTGATCCT ACAATAAGCA 2160
ATTGTTTTAT TGCCTTCCAG GATAAAATCG TAAATCTGCT CACCTTTCCT CAGATGTCAT 2220
AAATGTTCAT ATCATAAGGG ATGTGAGAAA CAGTATGAGC TGGTTTATAA GTATGAGCCA 2280
TAATCCTAGT AATGCTTTTC TTAGCGAAAG CACCACTAAT AATCAGTAAT TGCCATTGTT 2340
TAAAAATTAA GCAC 2354