EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10310 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr25:13161649-13162817 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr25:13162050-13162069TGGCCAGCTGGTGGCGCTA+6.84
CTCFMA0139.1chr25:13161745-13161764CTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.36
Hmx3MA0898.1chr25:13162617-13162634AGCAGCACTTAATTAAT+6.19
IKZF1MA1508.1chr25:13161865-13161877ACTTCCTGTTCC-6.44
Enhancer Sequence
GGCATGTAGA TGCCTTCAGT AGAAGAATTT AATCAACCAT GTGACGTTTC AGGCAGGTCA 60
GACATTGTGT GGCTAAGTTA TGAGCCAAAC TACCTTCTGC CAGCAGGTGG CGCTATGACT 120
GACTCAATAT TGTTATATGG ATGTGTTCAG GAGAGGAATT TTATCAACCA TGTGAAGTTT 180
CAGGCAGATC GGACATTGTG TGGTTGAGTT ATAAGGACTT CCTGTTCCAT GGCGAAGCGT 240
TGAGGTTTGT CATGCCGCCA CGGACACACC CCTCTGCAAA AACTGTAGAT CTTCACAATA 300
TATCATCGCT AGAGCTTTCA GATGACAACA CCCAATTTTG GTGCTGATAC AATAAAATTT 360
GGTGAAGTAG TATGTTACAA TGTAAAACAT GTCATTTCCT GTGGCCAGCT GGTGGCGCTA 420
TAACTGTGAC TCAAGATTGT TATGTAGATG CCTTCAGTAG ATAAATTTTA TCAACCATGT 480
AAATTATCAG GCAGATCGGA TATTAGAGTT AGTGCAGGCC ATCACCACAT TTTTACTGCT 540
GTTACTGTAC ATCAATCAGT AATTAGACGT GACTAATTAA AATTTGTACA AATTCTGCAT 600
CTGGACAATC ACTATACCCA GCATCAACAG CACCACTTTT ATCTTTAGCA TCAGCCGCAC 660
TATCACCAGC ATCATTAGCA CCTGAACCAT CACCAGTATT AGCACCATCA GAAACATCAG 720
CTGCTCCAAC ACCATCCCCA GCAGCACCGG AACCATTACA AGCATTAGCA GCACTACAAT 780
CCTCAGCATC AACAGCACCA CCATTCCCAG CATCAGTACC ACCACCATCC CAATCCCCAA 840
CATCAGCATC AGCAGCACTA GAACCAACCA CAGAACCAAC CCCAACACCA GGAATCTGCG 900
TATGTAGAGA GAATGTTTAT GTAATGCTTG AATTGTTAAT GGATTTACCT TTGTTTAGGG 960
TGTTTATGAG CAGCACTTAA TTAATTACAT TATTGTTGGA ACTTCTATAT TGCAAACAGG 1020
ACTGAGCAGT GATGAAAATT ATTTTCCTGG CCTGTAACTG GGTGGAGAAC CAACACCACT 1080
TTCCTGTGAA GATTCAACTG CCAAAGATCT TAAGGATGAA GGAGGAATAT GCCTTGTTGG 1140
CTATCACAAT GCAAGATTTG TTCGTAAA 1168