EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10306 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr25:12580251-12581111 
TF binding sites/motifs
Number: 22             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr25:12580434-12580451GGAATTAATTAATTATT+7.07
DMRT3MA0610.1chr25:12580583-12580594AATGTATCAAA+6.02
DMRTA2MA1478.1chr25:12580583-12580595AATGTATCAAAT-6.04
DMRTC2MA1479.1chr25:12580583-12580595AATGTATCAAAT-6.74
Lhx3MA0135.1chr25:12580435-12580448GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr25:12580436-12580449AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr25:12580439-12580452TAATTAATTATTC+7.12
POU4F2MA0683.1chr25:12580438-12580454TTAATTAATTATTCCT-6.3
POU4F3MA0791.1chr25:12580438-12580454TTAATTAATTATTCCT-6.12
POU6F1MA0628.1chr25:12580437-12580447ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr25:12580437-12580447ATTAATTAAT-6.02
Spz1MA0111.1chr25:12580887-12580898GCTGTAACCCT-6.14
ZNF384MA1125.1chr25:12580386-12580398AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:12580387-12580399AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:12580388-12580400AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:12580389-12580401AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:12580390-12580402AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:12580391-12580403AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:12580392-12580404AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:12580627-12580639TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr25:12580626-12580638TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr25:12580625-12580637ATTAAAAAAAAA+6.74
Enhancer Sequence
AGCTGCCTAG ATAAGTTGAA GTCAAGATAT GAAAACTGTT GCGCATCCCC GAATGTAACT 60
CTGGCATTGA GAACAGAATT CTGTAAATCG AATTATTAAT TTGTATACCT TAAATTCTTA 120
ATATGGTCAA CATTGAAAAA AAAAAAAAAA AAACTATGCT GACATTTTTT ATCAAACACA 180
CATGGAATTA ATTAATTATT CCTACACAGA TACATACATT TATAATCCTA ATTAATCTTC 240
TCATCTGCCG TATTTATTTA AAAATATTTT AGACATATTT GAGTCACACT TACATGCCCC 300
TTGATAAGTA TTATTGTTCC TTCTGTATCT AAAATGTATC AAATGTATTG GGACAATTAT 360
TTCACACTGC TTTCATTAAA AAAAAAAACT TGGTAACTTG TTTGTTTGTC CAAGTTACAT 420
TAACTAAAAA AAGATAGGGC TTTCCTATAG CTCATATCTA ATCATGACTC TGAAAAAAAC 480
TAAATCTTAA CCAGCAAACA GCCTTTTAAA GAGGATCCAG AAAGTGAAGA GCGGCCAAAA 540
ATGTCCTCAC TTGACAGTCT TGGTCCTCAT TCTGATGGTC CAAATCTCAA AGCCGTACTT 600
ACAAGTACAC ACAAACACGT TCGAACCACA CCACAAGCTG TAACCCTGTT TAAACCTTCG 660
CATGTCACAC ACACGGTTTC TTACACACAC AGATGCACTA GGCTTGGTTG GCTGGATGAA 720
GAGAGCCTCG AGCAGAAAGG AAGAGGTGCA ATCGATGAGC ATCGACATGC AATACTGCAC 780
CAAGACAGAC ACTGCACAAA CAAGGAGAGA GAGGGAGATT CTGAGATTTT AATCAAACAT 840
TTATTTCACA TTTTATATTT 860