EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10232 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr25:6797195-6798623 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr25:6798067-6798084ATTGATTAATTAATTCG-8.7
Alx4MA0853.1chr25:6798067-6798084ATTGATTAATTAATTCG-7.06
HNF1AMA0046.2chr25:6798055-6798070GTTTAATAATTAATT-6.21
Hmx3MA0898.1chr25:6797625-6797642ATTGATTAATTGATGGA-6
Lhx3MA0135.1chr25:6798070-6798083GATTAATTAATTC-6.54
PBX1MA0070.1chr25:6797736-6797748TTTGATTGATTG-6.18
POU6F1MA0628.1chr25:6798071-6798081ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr25:6798071-6798081ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr25:6797449-6797469TTTGGTTGGTTGGTTGGTGG-6.4
ZNF24MA1124.1chr25:6797550-6797563GATTCATTCATTC+6.74
ZNF24MA1124.1chr25:6797640-6797653GATTCATTCATTC+6.74
ZNF24MA1124.1chr25:6797648-6797661CATTCATTCATTT+7.34
ZNF24MA1124.1chr25:6797554-6797567CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr25:6797570-6797583CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr25:6797574-6797587CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr25:6797578-6797591CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr25:6797644-6797657CATTCATTCATTC+7.82
ZNF384MA1125.1chr25:6798416-6798428TTTTTTTTTATC-6.02
ZNF384MA1125.1chr25:6798415-6798427TTTTTTTTTTAT-6.27
ZNF384MA1125.1chr25:6798414-6798426TTTTTTTTTTTA-6.37
Enhancer Sequence
ACGGGCTGCC ACTCAATTGT CATGACAGCC TTGTTTCTGA GTGCCAATTA TGAGACTGTC 60
ATCGGCCAGC GGATTTCCAG ACCCTGTCAG AGACACAAAC CCCGAGTCTA AACAACTGGA 120
GGAATCAAGA GCGTCTGGAG TCACAGCTAA ACCACTCGGC TACAGATTTT GATGCAGTTT 180
AGGTTTTTTG TGGACACTTG TTTGCTAATA AATTAAATAT ATACATGTAA TTGGTTGCTT 240
GATTAATTGA TTCATTTGGT TGGTTGGTTG GTGGGTTGAT TAGTTTATTG GTGGATTGAT 300
TGGTTGATTC ATTTGTTTGG TTTCTTGATC GGATTGATTG ATTGATTGAT TGATTGATTC 360
ATTCATTCAT TCTATCATTC ATTCATTCAT TCATTCAGTT ACTTTCTTGA TTGGTTTGGT 420
TTCTTGAATG ATTGATTAAT TGATGGATTC ATTCATTCAT TCATTTGGTT GGTTGGTTGG 480
TTGGTTCATT TAGTTGGTTT CTTGATTGGT TTGGTTTCTT GATTGATTTC TTGATTGATT 540
GTTTGATTGA TTGATTGATT GATTGATTGA TTGATTGATT GATTGATTGG TTTCTTAATT 600
GGTTTGTTTT TTTGATTGGT TGGTTGGTTG ATTGATTCAA TTAATTGGTT TCTTGGTTGG 660
TTGGTTTGAT GATTGATTGA TTGATTGATT GATTGATTGA TTGATTGATT GATTGATTGA 720
TTGATTGATT GATTTCTTAA TTGGTTTGGT TGGTCGGTCG GTCCGTCGGT CCGTCCGTCG 780
GTCGGTTGAT TGATTGATTG ATTGATTGAT TGATTTGGTT GTTTGTTTTT TTTTGATTGG 840
TTAGGTTTCT TGATTGGTTA GTTTAATAAT TAATTGATTA ATTAATTCGT TGGTTGATTG 900
GTTGGTACAT TGATTGGTTG ATAGTTTTCT TTATTTGGAT GGTTTCTTGA TTGATTGATT 960
TATTGATTGA TTAATTATAC TTATAATTTG TGGGATAAAA AGGTTGAAAC ATTCGTTAAA 1020
AATACTTATG GATTCACAGA AAACAGAACG GACTCTAAAA AAGACATGAA GGAGAGTAAA 1080
CGATGATGCA ATTTTCACGT GTAAACTATT TCTTTAACTG TCCCCAAACC CTTCCTTACA 1140
TTTCCCACTG AAAAGCATCA CAGTGTTTTT TTTTCCCCCT GAAACTCACA TACAGCCTTA 1200
CGTCTGCTTC GTGTATCTGT TTTTTTTTTT ATCCCCGATG CCATCACATC CATCGCAAAC 1260
GCTCAGAAAA GTAAAGCAAA GGAAACAGAT TGGAGTGTAA AGTTTCAGAT CTACCCGGAG 1320
ACTTCTGGCT TCTGAATCAT CCATGAATAT GTAATGGCAA ACCGTCTAAA TATAGATTTG 1380
CCAGCGATCC CCATAGTGTG TGTCAGACAG CGAGAGACAG TAATCCAA 1428