EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10220 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr25:5824112-5826443 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr25:5825454-5825465AAGCAATAAAA+6.32
ESR1MA0112.3chr25:5826226-5826243ACTGTCACGGTGACCTT+6.28
HOXD9MA0913.2chr25:5825456-5825466GCAATAAAAC+6.02
RFX5MA0510.2chr25:5825722-5825738GGTGGCCATAGCAACC+6.05
RFX5MA0510.2chr25:5825722-5825738GGTGGCCATAGCAACC-6.15
Enhancer Sequence
ATGCTGGCTT GGACAACTTG AACAACTCCA CAAAACTTAC ATTTGTGAGA TTTTCTTTTT 60
TGTTAAGTAA AATAACAGAA AAAAAACAGC ATTGGCATAG TGCGTTCTTT TGACAGTGGG 120
CAAGAAATAC ACCTCAACCA CATCTGCAAC CACTAAGCAA TCAGCCTGAC TGCATTACAG 180
TAGTAACCAC TGCATACATT CTAGCAACCA CCCTAATTCT AGTAAAACTT CTATAGCAAA 240
AACATCCAAA AGACCCTATA ACCACCTACA AACCACCTCA TGCCCAAGGA AATAAGTGCC 300
TAACAACCAC CTCAAAAGCC TCATCATTCT GAATCCCATA GCAACCATTA CACCCCTTAA 360
GCAACCACCC AAATGGGTCA CCATCAATAA CAGCCACTCT AGAAACCACC TAGTAATGAT 420
TTAAGCAGCC ACCCAAAATA GCTAAACAAT GAATAAGCTG TCACACTAAA TGCCATAGCA 480
GCCACACTAG AGACCACCAA GAAACCACCT AAAACATTCT AGCATCCACC TTCTATACCC 540
TAAACACTAG CAAAAACACA AAACACCCTA GTAACCACCT AGCAACAACC TCAAATAGCC 600
AAGCAAAGTG GCCAAGCAAC TACCTCAAAA GCCTACTGAC CACCCTAAAG GCTGATTTAT 660
ACTTCTGACG CATAGCCCTT TGGCGTCGCT GACGTGCACC TCTCAAAAAA TGTAACTACA 720
CGACGCAACG ACGCATAGCG CAAGCTCTGT GATTGGTCGG CTTGGTAGCG CTGACGAGTC 780
TGGGCGGGAA TGGTGCGAGC CTGATAGAGC GATTGTTTAC AAGTGTGGAG TTCCGTGAAG 840
GAGCTCCGGA TGTAAAGTTT TGTTTTGTGT TTACTTCATA GTTAAAGTTG TTGCACGTCC 900
GCCGGTTCCT GCCTCAAAAT GAGCGAGTTT GAGCCACTTG TACATCCAGG AAGTGTTCAG 960
GAAAAGCAAA ACAACAGCGA AGAAACTCGA CACAGAGGAA CATTTACACC TCACTGCCAA 1020
CTAGCATTTC GGAAGTGTTA ATGCAGACCA ACAGAGACAG CGCGCAGAAG TATAAATGCA 1080
CAGCTACGCG CGTTGCATGC GCCGTGGGTT ACGCCGGTCA CTTGACGCAG AAGTATAAAC 1140
CAGGCTTAAA CACCTAGCAA CCACCCCAAA CACAGCAGCT AACCTGACTT ACTTTCACCC 1200
ACCTTAAATG GCGAAAATAT ACCTGTAAAA AAACCAAACA CCCCAAAAAC TGCTCTAGAA 1260
AAAAAACTGA ATGCCCTAAT AACCACCTTA ACCCTAACAA TCATCCTTTA ACACCTAGCA 1320
AACACCATGT ATGACCATCA ACAAGCAATA AAACCCAAAA CATCACAGAA AAAACGTTAG 1380
CAACCATTCC ATCCTTAACC CAGAGGTGTC CAAACATGGT CCTGGAGGGT TAGTGTCCTG 1440
CATATTTCAG TTCCAACCCC AATTAAACAC ACCTGAACTA GCTAATCTAG CTCTTTCTAG 1500
GTAGAAATCT TCAGGAAGGT GTGTTGAAGG AAGTTGAAGC TAAACTATGC AGGACATCGG 1560
CCCTCCAGGA CTGAGTTTGG ACACCCCTGC CTTGACCCAT CACATCCTAA GGTGGCCATA 1620
GCAACCATTA GAACTCCCAT GCCACTCTAG AGTTCACCTA GAAACCACTT ACACCATCCA 1680
GAAACCACCT AGCAACCTCA TCTCCTAAGA ACTGCTTAGC ATTCCTACAT TCATAGCAAA 1740
AATTAAAACC CTAACAACCA CCCCAGCAAT GTAACCACCT AAAGATCCTA GAAACCACTT 1800
ACCAAGACCC AAGCAACTGA ATAACACCTC TACATTTCCC CTACGATATT TTCTGATTGT 1860
GTATTTTTAA AATGAATTTA CTGTCCCTGT CTACTCCTGC CACTAGAGGC CGCCATATCC 1920
TTATGAAAAC AGCCAAGCGA ACATCAGCTC AGTTGTGTTT GTTTTGATGA CCGAGACTCA 1980
CTGAACCCGG ATCAGAATTT ACAGCCAGTC GCATTTCTAT CATGCAGCTC TGGCCCCTGT 2040
ACAGGATATT AATTTTCCCC AACGTTTTCA TTTCCTACCC AAGATGGCCT TTAAAGTGTC 2100
TGTCTATCTT TCACACTGTC ACGGTGACCT TTTCACACAC AGACGAACAC ATGCGTGGCA 2160
CGTACAAACC AAACACACTC TCACATGTGA GCAATTCATC ACATACTGTG GAAGGAATGA 2220
TGACATCCGA TCTTGTTTGT ACATTCGGAT GCACACAAAT GCAATGCAAA CACGACCTCG 2280
TACGTGCGAG AGATCACACA CACATGCTAT CTGCCTGTCT GCTCGGGTCA T 2331