EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10214 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr25:5325297-5327828 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
SNAI2MA0745.2chr25:5327767-5327777TGCACCTGTT-6.02
ZNF24MA1124.1chr25:5325312-5325325TAATGAATGAATG-7.12
ZNF24MA1124.1chr25:5325316-5325329GAATGAATGAATA-7.52
ZSCAN4MA1155.1chr25:5326379-5326394TGCACACACTCAAAC+6.44
ZSCAN4MA1155.1chr25:5326287-5326302TGCACACACTCACAA+6.47
ZSCAN4MA1155.1chr25:5326489-5326504TGCACACACTTAAAC+6.96
Enhancer Sequence
AGGCAGAAGG AAAATTAATG AATGAATGAA TATAATCCCA GATCTTCAGG AGTTTTATTT 60
GTCTCCTCGT GTTTTGTAAC AGCTCTTCTT TTCTCTCTCT GTTCATCTCT GATCTTCTCT 120
GTAAAGCTCC ATTGTGGTCA TAGAGGACTG CTTTGAGGGG TGCATGTCNN NNNNNNNNNN 180
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 240
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 300
ACACACACAC ACACACACAC GCACACGCAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 360
ACACACACAC ACACACACTC GCATTATTGT TCAATTACTA ACACTCAGAT GCACAGAATA 420
GCTCAGATGT GGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTATG 480
ATAGTGTTTC CAGCTGTAGG GATTGATCGC AGAATGAGAG TGTAATGGGA GATGAGCTCT 540
CATCTCAACT CTCACTGGAA CAGAACAGAG ATTTGGTTAC AAACACCAGG CGTATGACAC 600
ACACCACACA CACATGCACA CACGCACAGC AGCACGTGTG ATCACAAATC TCCAGACAGC 660
GTCACACATC CTCGGAAATC TTCAAAAGGA AAATTGTGAA TGCTAATCAG ATGTTTTTGT 720
CTATTTCTGG CATGTGAAGA CTCTAATGCT CACGCTAATT AAACCCTCCA TAATAAACCT 780
CCTCTATTCT GTCTCTCTCT CACACGCACA CACACTTACA CAAACACACA CGTGCACACA 840
CACTCATGCA TACATACAGA TACTCACACG CATACTCGTG CACACACACT CACAAAAACA 900
TAGACATTCA CATTCATGCA CACACACACT CACTCGCACT CACACACACA CTGACTTACA 960
CATGCACATA CACACTTACA AACACAATCA TGCACACACT CACAAATAAG CACACATGCA 1020
CATGTGCATA CACACTCACG CACACAATCA AACGTACACA CACATGCGCA CATACACACT 1080
CATGCACACA CTCAAACATA CACACACATG CACACACACA CAAACAAGCA AGCACGCTCA 1140
CACTCGCACA TAAACATTCG AACATTCACA CACCCACTCA CACTTACACT CATGCACACA 1200
CTTAAACATA CACACAAGTA CACATACTCA CACATACACA CACACACTAA AACACTTCAC 1260
ACCCACACTC ACGTGCACAC ATACACAGTC ACACTCACAC TCAAGTACAC ACACATGCAC 1320
TCATGCACAC TAACACAACA AAGACCCACA CACACACAAT ATTGCACTTA CACACACTCA 1380
CACTCACAAA TACTCTCACG CACACTCAAA AATACGCACA CAAGCAGACA CATTTACACA 1440
TATACACACA CACACCCACA CACACACACA CACACACTCA CAATATTGCA CTTACACACA 1500
CTCACACTCA CAAATACTCT CATGCACACT CAAAAATACG CACACAAGCA GACACATTTA 1560
CACATATACA CACACACACA CACAATATTG CACTTACACA CACTCACACT CACAAATACT 1620
CTCACGCACA ATCAAAAATA CGCACACAAG CAGACACATT TACACATATA CACACACACA 1680
CACACACAAT ATTGCACTTA CACACACTCA CACTCACAAA TACTCTCACG CACACTCAAA 1740
AATACGCACA CAAGCAGACA CATTTACACA TATACACACA CACACACACA CACACACACA 1800
CAATATTGCA CTTACACACA CTCACACTCA CAAATACTCT CACGCACACT CAAAAATACG 1860
CACACAAGCA GACACATATA CACACACACA CACACAATAT TGCACTTACA CACACTCACA 1920
CTCACAAATA CTCTCACGCA CACTCAAAAA TACGCACACA AGCAGACACA TTTACACATA 1980
TACACACACA CACACACACA ATATTGCACT TACACACACT CACACTCACA AATACTCTCA 2040
CGCACACTCA AAAAAACGCA CACAAGCAGA CACATTTACA CGTGAACACA CACACACACA 2100
CACACACACA CACACACACA CACACTGGCC ACTCAGAACT ACCTTAATCC TTCGTGGCAA 2160
AGATTCAACA AGATACTTAG CTTGATTATT GTAAATAACT AAAATAAAGC TTCTCTCATT 2220
TTATCCCTCA ATATCTCATC TCATCATTTT TTTGTGTTAT TGTTTCATCC GGTCTGATCA 2280
GAATTTTGCT CATGATATGT TTTGCCTCAT AACTTCTCAC TCTCATTTTT TTCATTTTCA 2340
TTCAGACAAC TCCACCGTTT CTTCTCGTCT TGCATTCTAG CTTGTTCATC TCCAGATTTA 2400
TGTCTTGTCA TTCTTTTCTC AATCTCTCAT TTCATTTTTC ATGTGTTTTT CTGCTTTGGC 2460
TGTGCTCGAT TGCACCTGTT GCTGTCAGTG TGAGTGTATG AAACTGTGTG TGTATGTGTG 2520
TTAGCTGTAC A 2531