EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR007-10208 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_5-6ss 
Coordinate
chr25:5015964-5017123 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr25:5016235-5016252AGGTCAGATTGAGGTCA+6.9
Rarb(var.2)MA0858.1chr25:5016235-5016252AGGTCAGATTGAGGTCA+7.49
TEAD2MA1121.1chr25:5016985-5016998TGCTGGAATGTGT-6.16
ZNF143MA0088.2chr25:5016971-5016987TTCCCAGAGTGCATTG+6.23
Enhancer Sequence
CGGTTTCCCC CACAGCCCAA AGACATGCGG TACAGGTGAA TTGGGTAGGC TAAATTGTCC 60
GTAGTGTATG AGTGTGAAAA AGTCTGAATG GGTGTTTCCC AGCAGCTGGA AGGGCATCTG 120
CTGCGTGAAA CGTGCTGGAT AAGTTGGCGG TTCATTCCAC TGTGGCGACC CCGGAATAAT 180
AAAGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTTTGTG TGTGTGTGTC GCTCATTGTT AAGTTGATAG 240
CGGCTGTTGG ACTGATCTGT ATCGGCCATT GAGGTCAGAT TGAGGTCAGT GAGAAGCCCA 300
CCTGTCAACA GGTGCTGGAA CACAATAACA CACCTGTCCC ACACACACGC ACACACACAC 360
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACAGAGAG AGAGAGAGAG AGACAGACAG 420
TCATTTTCTC TCTCTTGCTC TCTCTTACAA AGACACACAC TCTTTTTCAT ACACACACAT 480
ACTGGCAGAG ACACACACTT ACAGAGATAC ACACACTAAC AGACAGAAAC ACACATAACA 540
GATGCTCACT CGCAGAGGTA CTTGCAGACA CACACAGCGA GACACATTCA TTCACACACA 600
CATACACAGA ATCATTCACA TACACACACA ATCACAGAGA TGAACACACA CACACACACA 660
CACACACACA CAAACATGTG CATGCCTCAC ACACACACAC ACACACACAC ACAGAATCAT 720
TCACATAAAC ACACACACAG ACACACATAT ACAGAATCGT TTACATACGC ACACACACAA 780
TCATTCACAT ATACACACAA TCATGCACAC ACACACAGTC ACAGAGATGC ACACACTAAC 840
AGAGACTCAT TTATCAAAAA CACACATAAA AACAGACACT CACTCATACG CGCACACACA 900
CACACACACA CACACACACA CGCACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 960
CACACACCGA TCTGTGTGTT CTGTTCCCTC TCCCGTCTTC TTGATTTTTC CCAGAGTGCA 1020
TTGCTGGAAT GTGTGTGAGA GTGAGCAGGA GATGAGGTCA CAGGAAGTCA AGCCCTGGCT 1080
GCAATTGTGT GGAAAAAGGG ACACTTCCTG TTCACCTCCC AAGAGCAGGT CATTCTTATA 1140
TTCAACTGCA GACAACAAC 1159